杜仲MEP途径系列基因5'端非编码区的顺式作用元件预测

乌云塔娜; 刘慧敏; 杜红岩

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杜仲MEP途径系列基因5'端非编码区的顺式作用元件预测

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为深入了解杜仲MEP途径基因5'端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5'端非编码区顺式作用元件的结构和功能.生物信息学分析表明:EuDXS2基因5'端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5'端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATA-box和32个CAAT-box; EuCMK基因5 '端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box; EuMDS基因5'端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box; EuHDS基因5'端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box; EuHDR基因5'端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box.

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来源
《经济林研究》 |2013年第4期|9-15|共7页
作者
乌云塔娜; 刘慧敏; 杜红岩;
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作者单位

中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003;

国家林业局杜仲工程技术研究中心,河南郑州450003;

中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙 410004;

中南林业科技大学林学院,湖南长沙 410004;

中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003;

国家林业局杜仲工程技术研究中心,河南郑州450003;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类遗传育种;
关键词
杜仲; MEP途径; 5'端非编码区; 顺式作用元件;

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