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Comparative Phenotype and Genome Analysis of Cellvibrio sp. PR1, a Xylanolytic and Agarolytic Bacterium from the Pearl River

机译：Cellvibrio sp。的比较表型和基因组分析。 PR1，来自珠江三角洲的木糖分解和糖化细菌

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Cellvibrio sp. PR1 is a xylanolytic and agarolytic bacterium isolated from the Pearl River. Strain PR1 is closely related to Cellvibrio fibrivorans and C. ostraviensis (identity > 98%). The xylanase and agarase contents of strain PR1 reach up to 15.4 and 25.9 U/mL, respectively. The major cellular fatty acids consisted of C16:0 (36.7%), C18:0 (8.8%), C20:0 (6.8%), C15:0 iso 2-OH or/and C16:1ω7c (17.4%), and C18:1ω7c or/and C18:1ω6c (6.7%). A total of 251 CAZyme modules (63 CBMs, 20 CEs, 128 GHs, 38 GTs, and 2 PLs) were identified from 3,730 predicted proteins. Genomic analysis suggested that strain PR1 has a complete xylan-hydrolyzing (5 β-xylanases, 16 β-xylosidases, 17 α-arabinofuranosidases, 9 acetyl xylan esterases, 4 α-glucuronidases, and 2 ferulic acid esterases) and agar-hydrolyzing enzyme system (2 β-agarases and 2 α-neoagarooligosaccharide hydrolases). In addition, the main metabolic pathways of xylose, arabinose, and galactose are established in the genome-wide analysis. This study shows that strain PR1 contains a large number of glycoside hydrolases.
机译：细胞弧菌PR1是一种从珠江分离的木聚糖分解和琼脂分解细菌。 PR1菌株与纤维弧菌和C. ostraviensis密切相关（同一性> 98％）。 PR1菌株的木聚糖酶和琼脂酶含量分别达到15.4和25.9 U / mL。主要的细胞脂肪酸由C16：0（36.7％），C18：0（8.8％），C20：0（6.8％），C15：0 iso 2-OH或/和C16：1ω7c（17.4％）和C18：1ω7c或/和C18：1ω6c（6.7％）。从3,730个预测的蛋白质中鉴定出总共251个CAZyme模块（63个CBM，20个CE，128个GH，38个GT和2个PL）。基因组分析表明，菌株PR1具有完整的木聚糖水解酶（5种木聚糖酶，16种木糖苷酶，17种α-阿拉伯呋喃糖苷酶，9种乙酰木聚糖酯酶，4种α-葡糖醛酸糖苷酶和2种阿魏酸酯酶）和琼脂水解酶系统（2个β-琼脂糖和2个α-新葡糖寡糖水解酶）。另外，在全基因组分析中建立了木糖，阿拉伯糖和半乳糖的主要代谢途径。这项研究表明，菌株PR1含有大量的糖苷水解酶。

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