首页> 美国卫生研究院文献>Genome Biology >MethMarker: user-friendly design and optimization of gene-specific DNA methylation assays

【2h】

MethMarker: user-friendly design and optimization of gene-specific DNA methylation assays

机译：MethMarker：人性化设计和基因特异性DNA甲基化检测的优化

代理获取

本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

DNA methylation is a key mechanism of epigenetic regulation that is frequently altered in diseases such as cancer. To confirm the biological or clinical relevance of such changes, gene-specific DNA methylation changes need to be validated in multiple samples. We have developed the MethMarker software to help design robust and cost-efficient DNA methylation assays for six widely used methods. Furthermore, MethMarker implements a bioinformatic workflow for transforming disease-specific differentially methylated genomic regions into robust clinical biomarkers.

机译：DNA甲基化是表观遗传调控的关键机制，这种机制在诸如癌症等疾病中经常发生变化。为了确认此类变化的生物学或临床相关性，需要在多个样品中验证基因特异性DNA甲基化变化。我们已经开发了MethMarker软件，以帮助设计六种广泛使用的方法的可靠且经济高效的DNA甲基化测定。此外，MethMarker实施了生物信息学工作流程，可将疾病特异性差异甲基化的基因组区域转化为可靠的临床生物标记。

著录项

期刊名称 Genome Biology
作者
Peter Schüffler; Thomas Mikeska; Andreas Waha; Thomas Lengauer; Christoph Bock;
展开▼
作者单位

展开▼
年(卷),期 2009(10),10
年度 2009
页码 R105
总页数 10
原文格式 PDF
正文语种
中图分类生物学;
关键词

相似文献

外文文献
中文文献
专利

1. Development of an intracellular, DNA methyltransferase-specific, and gene-specific assay for studying dynamic DNA methylation. [J] . Jesus Gonzalez-Bosquet, Yongli Chu, Hai Bin Chen, Current pharmaceutical design . 2014,第11期

机译：开发一种用于研究动态DNA甲基化的细胞内DNA甲基转移酶特异性和基因特异性测定方法。
2. Development of an intracellular, DNA methyltransferase-specific, and gene-specific assay for studying dynamic DNA methylation. [J] . Jesus Gonzalez-Bosquet, Yongli Chu, Hai Bin Chen, Current pharmaceutical design . 2014,第11期

机译：开发一种用于研究动态DNA甲基化的细胞内DNA甲基转移酶特异性和基因特异性测定方法。
3. Design of a user-friendly and rapid DNA microarray assay for the authentication of ten important food fish species [J] . Kappel Kristina, Eschbach Erik, Fischer Markus, Food Chemistry . 2020,第May1期

机译：一种易于使用且快速的DNA芯片检测方法的设计，用于鉴定十种重要食用鱼类
4. Beyond the mean: quantile regression to explore the air pollution effect on gene-specific DNA methylation in the Normative Aging Study [C] . Marie-Abele Bind, Brent A. Coull, Annette Peters, Annual conference of the International Society of Exposure Science . 2014

机译：超越均值：分位数回归以探讨空气污染对规范老化研究中基因特异性DNA甲基化的影响
5. Progressive, non-random altered patterns of methylation in gene-specific and GC-rich regions of DNA underlie tumorigenesis. [D] . Bachman, Ammie Norene. 2006

机译：基因特异性和富含GC的DNA区域中甲基化的进行性，非随机改变模式是肿瘤发生的基础。
6. MSP-HTPrimer: a high-throughput primer design tool to improve assay design for DNA methylation analysis in epigenetics [O] . Ram Vinay Pandey, Walter Pulverer, Rainer Kallmeyer, 2016

机译：MSP-HTPrimer：一种高通量引物设计工具可改善表观遗传学中DNA甲基化分析的分析设计
7. MethMarker: user-friendly design and optimization of gene-specific DNA methylation assays [O] . Peter Schüffler, Thomas Mikeska, Andreas Waha, 2009

机译：MethMarker：人性化设计和基因特异性DNA甲基化检测的优化

MethMarker: user-friendly design and optimization of gene-specific DNA methylation assays

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅