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Ultradeep Pyrosequencing Detects Complex Patterns of CD8+ T-Lymphocyte Escape in Simian Immunodeficiency Virus-Infected Macaques

机译:超深焦测序技术在猿猴免疫缺陷病毒感染的猕猴中检测到CD8 + T淋巴细胞逃逸的复杂模式。

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摘要

Human and simian immunodeficiency viruses (HIV/SIV) exhibit enormous sequence heterogeneity within each infected host. Here, we use ultradeep pyrosequencing to create a comprehensive picture of CD8+ T-lymphocyte (CD8-TL) escape in SIV-infected macaques, revealing a previously undetected complex pattern of viral variants. This increased sensitivity enabled the detection of acute CD8-TL escape as early as 17 days postinfection, representing the earliest published example of CD8-TL escape in intrarectally infected macaques. These data demonstrate that pyrosequencing can be used to study the evolution of CD8-TL escape during immunodeficiency virus infection with an unprecedented degree of sensitivity.
机译:人和猿猴免疫缺陷病毒(HIV / SIV)在每个感染宿主内均表现出巨大的序列异质性。在这里,我们使用超深焦磷酸测序技术来绘制SIV感染猕猴中CD8 + T淋巴细胞(CD8-TL)逃逸的综合图,揭示了以前未发现的病毒变体的复杂模式。这种提高的灵敏度使得最早在感染后17天就可以检测到急性CD8-TL逃逸,这代表了直肠内感染猕猴中CD8-TL逃逸的最早公开实例。这些数据表明,焦磷酸测序可用于研究免疫缺陷病毒感染过程中CD8-TL逃逸的进化,并具有前所未有的敏感性。

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