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Data supporting beta-amyloid dimer structural transitions and protein–lipid interactions on asymmetric lipid bilayer surfaces using MD simulations on experimentally derived NMR protein structures

机译:在实验衍生的NMR蛋白质结构上使用MD模拟支持不对称脂质双层表面上β-淀粉样二聚体结构转变和蛋白质-脂质相互作用的数据

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摘要

This data article supports the research article entitled “Maximally Asymmetric Transbilayer Distribution of Anionic Lipids Alters the Structure and interaction with Lipids of an Amyloidogenic Protein Dimer Bound to the Membrane Surface” . We describe supporting data on the binding kinetics, time evolution of secondary structure, and residue-contact maps of a surface-absorbed beta-amyloid dimer protein on different membrane surfaces. We further demonstrate the sorting of annular and non-annular regions of the protein/lipid bilayer simulation systems, and the correlation of lipid-number mismatch and surface area per lipid mismatch of asymmetric lipid membranes.
机译:该数据文章支持题为“阴离子脂质的最大不对称双分子层分布改变了结合到膜表面的淀粉样蛋白二聚体的结构和与脂质的相互作用”的研究文章。我们描述了结合动力学,二级结构的时间演变和表面吸附的β淀粉样二聚体蛋白在不同膜表面上的残基接触图的支持数据。我们进一步证明了蛋白质/脂质双层模拟系统的环形和非环形区域的排序,以及脂质数量不匹配和不对称脂质膜的每个脂质不匹配表面积的相关性。

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