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Genetic variants and phylogenetic analysis of Haemophilusparasuis (HPS) OMPP2 detected in Sichuan China from 2013 to2015

机译:嗜血杆菌的遗传变异和系统发育分析2013年至2013年在中国四川省发现副猪(HPS)OMPP22015年

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摘要

To investigate the genetic variation in Haemophilus parasuis (HPS) in Sichuan, China, 11 isolates were analyzed based on the outer membrane protein P2 (OMPP2) sequence. Sequence analysis showed that the 11 isolates shared 93.0 to 100% nucleotide homology with 15 reference strains, and the consistency between the 26 strains was 89.0%. The isolates of HPS-1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 10 and 11 had a 69-base deletion from 770 base pairs (bp) to 850 bp, which was infrequent in China. The phylogenetic tree showed that HPS-3 and HPS-8 had closer relationships with European and Japanese strains, but shared 98.7% nucleotide homology with the SW114 Japanese strain.
机译:为调查中国四川省副猪嗜血杆菌(HPS)的遗传变异,根据外膜蛋白P2(OMPP2)序列分析了11种分离株。序列分析表明,这11个菌株与15个参考菌株具有93.0至100%的核苷酸同源性,这26个菌株之间的一致性为89.0%。 HPS-1、2、4、5、6、7、8、10和11的分离株从770个碱基对(bp)到850 bp具有69个碱基的缺失,在中国很少见。系统进化树表明,HPS-3和HPS-8与欧洲和日本菌株有更紧密的关系,但与SW114日本菌株具有98.7%的核苷酸同源性。

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