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首页> 美国卫生研究院文献>BMC Genetics >PoPoolation DB: a user-friendly web-based database for the retrieval of natural polymorphisms in Drosophila
【2h】

PoPoolation DB: a user-friendly web-based database for the retrieval of natural polymorphisms in Drosophila

机译：PoPoolation DB：基于用户友好的基于Web的数据库用于检索果蝇中的自然多态性

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BackgroundThe enormous potential of natural variation for the functional characterization of genes has been neglected for a long time. Only since recently, functional geneticists are starting to account for natural variation in their analyses. With the new sequencing technologies it has become feasible to collect sequence information for multiple individuals on a genomic scale. In particular sequencing pooled DNA samples has been shown to provide a cost-effective approach for characterizing variation in natural populations. While a range of software tools have been developed for mapping these reads onto a reference genome and extracting SNPs, linking this information to population genetic estimators and functional information still poses a major challenge to many researchers.
机译：背景技术长期以来，人们一直忽略了自然变异对基因功能表征的巨大潜力。直到最近，功能遗传学家才开始考虑其分析中的自然变异。利用新的测序技术，在基因组规模上收集多个个体的序列信息变得可行。特别地，测序汇集的DNA样品已显示出提供了一种经济有效的方法来表征天然种群的变异。尽管已经开发出了一系列软件工具来将这些读物定位到参考基因组上并提取SNP，但将这些信息与群体遗传估计量和功能信息联系起来仍然对许多研究人员构成了重大挑战。

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