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Biomolecular network querying: a promising approach in systems biology

机译：生物分子网络查询：系统生物学中的一种有前途的方法

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摘要

The rapid accumulation of various network-related data from multiple species and conditions (e.g. disease versus normal) provides unprecedented opportunities to study the function and evolution of biological systems. Comparison of biomolecular networks between species or conditions is a promising approach to understanding the essential mechanisms used by living organisms. Computationally, the basic goal of this network comparison or 'querying' is to uncover identical or similar subnetworks by mapping the queried network (e.g. a pathway or functional module) to another network or network database. Such comparative analysis may reveal biologically or clinically important pathways or regulatory networks. In particular, we argue that user-friendly tools for network querying will greatly enhance our ability to study the fundamental properties of biomolecular networks at a system-wide level.
机译：来自多种物种和条件（例如疾病与正常）的各种与网络相关的数据的快速积累为研究生物系统的功能和进化提供了前所未有的机会。物种或条件之间的生物分子网络比较是了解生物体所用基本机制的一种有前途的方法。计算上，此网络比较或“查询”的基本目标是通过将查询的网络（例如路径或功能模块）映射到另一个网络或网络数据库来发现相同或相似的子网络。这种比较分析可以揭示生物学或临床上重要的途径或调节网络。特别是，我们认为用户友好的网络查询工具将极大地增强我们在系统范围内研究生物分子网络基本特性的能力。

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