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COBRApy: COnstraints-Based Reconstruction and Analysis for Python

机译：COBRApy：基于COnstraints的Python重构和分析

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BackgroundCOnstraint-Based Reconstruction and Analysis (COBRA) methods are widely used for genome-scale modeling of metabolic networks in both prokaryotes and eukaryotes. Due to the successes with metabolism, there is an increasing effort to apply COBRA methods to reconstruct and analyze integrated models of cellular processes. The COBRA Toolbox for MATLAB is a leading software package for genome-scale analysis of metabolism; however, it was not designed to elegantly capture the complexity inherent in integrated biological networks and lacks an integration framework for the multiomics data used in systems biology. The openCOBRA Project is a community effort to promote constraints-based research through the distribution of freely available software.
机译：背景基于原核的重构和分析（COBRA）方法已广泛用于原核生物和真核生物中代谢网络的基因组规模建模。由于新陈代谢的成功，人们越来越多地将COBRA方法应用于重建和分析细胞过程的集成模型。用于MATLAB的COBRA工具箱是用于代谢的基因组规模分析的领先软件包。但是，它的设计目的不是优雅地捕获集成生物网络固有的复杂性，并且缺少用于系统生物学的多组学数据的集成框架。 openCOBRA项目是社区的一项工作，旨在通过分发免费软件来促进基于约束的研究。

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