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JuPOETs: a constrained multiobjective optimization approach to estimate biochemical model ensembles in the Julia programming language

机译:JuPOETs:一种使用Julia编程语言估算生化模型集合的受限多目标优化方法

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摘要

BackgroundEnsemble modeling is a promising approach for obtaining robust predictions and coarse grained population behavior in deterministic mathematical models. Ensemble approaches address model uncertainty by using parameter or model families instead of single best-fit parameters or fixed model structures. Parameter ensembles can be selected based upon simulation error, along with other criteria such as diversity or steady-state performance. Simulations using parameter ensembles can estimate confidence intervals on model variables, and robustly constrain model predictions, despite having many poorly constrained parameters.
机译:背景集成模型是一种在确定性数学模型中获得鲁棒预测和粗粒度种群行为的有前途的方法。集成方法通过使用参数或模型族而不是单个最佳拟合参数或固定模型结构来解决模型不确定性。可以基于仿真误差以及其他标准(例如分集或稳态性能)来选择参数集合。使用参数集成进行的仿真可以估计模型变量的置信区间,并且可以健壮地约束模型预测,尽管参数约束很多。

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