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首页> 美国卫生研究院文献>BMC Structural Biology >Sequence and structural analysis of the Asp-box motif and Asp-box beta-propellers; a widespread propeller-type characteristic of the Vps10 domain family and several glycoside hydrolase families
【2h】

Sequence and structural analysis of the Asp-box motif and Asp-box beta-propellers; a widespread propeller-type characteristic of the Vps10 domain family and several glycoside hydrolase families

机译：Asp-box基序和Asp-boxβ-螺旋桨的序列和结构分析； Vps10结构域家族和几个糖苷水解酶家族的广泛的螺旋桨型特征

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BackgroundThe Asp-box is a short sequence and structure motif that folds as a well-defined β-hairpin. It is present in different folds, but occurs most prominently as repeats in β-propellers. Asp-box β-propellers are known to be characteristically irregular and to occur in many medically important proteins, most of which are glycosidase enzymes, but they are otherwise not well characterized and are only rarely treated as a distinct β-propeller family. We have analyzed the sequence, structure, function and occurrence of the Asp-box and s-Asp-box -a related shorter variant, and provide a comprehensive classification and computational analysis of the Asp-box β-propeller family.
机译：背景Asp盒是一个短序列和结构基序，可折叠成定义​​明确的β-发夹状结构。它以不同的折叠形式存在，但最显着地以β-螺旋桨中的重复出现。众所周知，Asp-boxβ螺旋桨的特征是不规则的，并存在于许多医学上重要的蛋白质中，其中大多数是糖苷酶，但它们的特征不明确，很少被视作独特的β螺旋桨家族。我们分析了Asp-box和s-Asp-box（一个相关的较短变体）的序列，结构，功能和发生情况，并提供了Asp-boxβ螺旋桨家族的全面分类和计算分析。

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