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Comparison of blood RNA isolation methods from samples stabilized in Tempus tubes and stored at a large human biobank

机译:比较从Tempus管中稳定并保存在大型人类生物库中的样本中提取血液RNA的方法

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摘要

BackgroundMore than 50,000 adult and cord blood samples were collected in Tempus tubes and stored at the Norwegian Institute of Public Health Biobank for future use. In this study, we systematically evaluated and compared five blood-RNA isolation protocols: three blood-RNA isolation protocols optimized for simultaneous isolation of all blood-RNA species (MagMAX RNA Isolation Kit, both manual and semi-automated protocols; and Norgen Preserved Blood RNA kit I); and two protocols optimized for large RNAs only (Tempus Spin RNA, and Tempus 6-port isolation kit). We estimated the following parameters: RNA quality, RNA yield, processing time, cost per sample, and RNA transcript stability of six selected mRNAs and 13 miRNAs using real-time qPCR.
机译:背景技术在Tempus试管中收集了50,000多份成人和脐带血样本,并保存在挪威公共卫生研究所生物库中,以备将来使用。在这项研究中,我们系统地评估和比较了五种血液RNA分离方案:针对同时分离所有血液RNA物种而优化的三种血液RNA分离方案(MagMAX RNA分离试剂盒,手动和半自动化方案;以及Norgen Preserved Blood RNA试剂盒I);以及两种仅针对大型RNA进行了优化的协议(Tempus Spin RNA和Tempus 6端口分离试剂盒)。我们估计了以下参数:使用实时定量PCR的六个选定的mRNA和13个miRNA的RNA质量,RNA产量,处理时间,每份样品的成本以及RNA转录物的稳定性。

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