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New Knowledge from Old: In silico discovery of novel protein domains in Streptomyces coelicolor

机译:来自旧的新知识:在计算机上发现天蓝色链霉菌中新蛋白结构域的知识

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摘要

BackgroundStreptomyces coelicolor has long been considered a remarkable bacterium with a complex life-cycle, ubiquitous environmental distribution, linear chromosomes and plasmids, and a huge range of pharmaceutically useful secondary metabolites. Completion of the genome sequence demonstrated that this diversity carried through to the genetic level, with over 7000 genes identified. We sought to expand our understanding of this organism at the molecular level through identification and annotation of novel protein domains. Protein domains are the evolutionary conserved units from which proteins are formed.
机译:背景长期以来,腔肠链霉菌一直被认为是一种杰出的细菌,具有复杂的生命周期,无处不在的环境分布,线性染色体和质粒以及大量可药用的次级代谢产物。基因组序列的完成表明,这种多样性一直延续到遗传水平,已鉴定出7000多个基因。我们试图通过鉴定和注释新的蛋白质结构域在分子水平上扩大对这种生物的理解。蛋白质结构域是形成蛋白质的进化保守单位。

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