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Genome-wide association and genomic prediction identifies associated loci and predicts the sensitivity of Tobacco ringspot virus in soybean plant introductions

机译：全基因组关联和基因组预测可识别相关基因座并预测烟草环斑病毒在大豆植物引种中的敏感性

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BackgroundGenome-wide association study (GWAS) is a useful tool for detecting and characterizing traits of interest including those associated with disease resistance in soybean. The availability of 50,000 single nucleotide polymorphism (SNP) markers (SoySNP50K iSelect BeadChip; ) on 19,652 soybean and wild soybean plant introductions (PIs) in the USDA Soybean Germplasm Collection allows for fast and robust identification of loci associated with a desired phenotype. By using a genome-wide marker set to predict phenotypic values, genomic prediction for phenotype-unknown but genotype-determined PIs has become possible. The goal of this study was to describe the genetic architecture associated with sensitivity to Tobacco ringspot virus (TRSV) infection in the USDA Soybean Germplasm Collection.
机译：背景全基因组关联研究（GWAS）是检测和表征感兴趣的性状（包括与大豆抗病性相关的性状）的有用工具。在USDA大豆种质资源库中的19,652株大豆和野生大豆植物引入（PIs）上可获得50,000个单核苷酸多态性（SNP）标记（SoySNP50K iSelect BeadChip;），可快速，可靠地鉴定与所需表型相关的基因座。通过使用全基因组标记集来预测表型值，表型未知但基因型确定的PI的基因组预测成为可能。这项研究的目的是描述与USDA大豆种质资源库中对烟草环斑病毒（TRSV）感染的敏感性相关的遗传结构。

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