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BLAST-EXPLORER helps you building datasets for phylogenetic analysis

机译:BLAST-EXPLORER帮助您建立系统发育分析数据集

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摘要

BackgroundThe right sampling of homologous sequences for phylogenetic or molecular evolution analyses is a crucial step, the quality of which can have a significant impact on the final interpretation of the study. There is no single way for constructing datasets suitable for phylogenetic analysis, because this task intimately depends on the scientific question we want to address, Moreover, database mining softwares such as BLAST which are routinely used for searching homologous sequences are not specifically optimized for this task.
机译:背景正确采样同源序列以进行系统发育或分子进化分析是至关重要的一步,其质量可能会对研究的最终解释产生重大影响。没有任何一种方法可以构建适合系统发育分析的数据集,因为此任务与我们要解决的科学问题密切相关。此外,常规用于搜索同源序列的数据库挖掘软件(例如BLAST)并未针对此任务进行专门优化。

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