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NanoUPLC-MSE proteomic data assessment of soybean seeds using the Uniprot database

机译:使用Uniprot数据库对大豆种子进行NanoUPLC-MSE蛋白质组学数据评估

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摘要

BackgroundRecombinant DNA technology has been extensively employed to generate a variety of products from genetically modified organisms (GMOs) over the last decade, and the development of technologies capable of analyzing these products is crucial to understanding gene expression patterns. Liquid chromatography coupled with mass spectrometry is a powerful tool for analyzing protein contents and possible expression modifications in GMOs. Specifically, the NanoUPLC-MSE technique provides rapid protein analyses of complex mixtures with supported steps for high sample throughput, identification and quantization using low sample quantities with outstanding repeatability. Here, we present an assessment of the peptide and protein identification and quantification of soybean seed EMBRAPA BR16 cultivar contents using NanoUPLC-MSE and provide a comparison to the theoretical tryptic digestion of soybean sequences from Uniprot database.
机译:背景技术在过去的十年中,重组DNA技术已广泛用于从转基因生物(GMO)生成各种产品,并且能够分析这些产品的技术的开发对于理解基因表达模式至关重要。液相色谱与质谱联用是分析GMO中蛋白质含量和可能的表达修饰的强大工具。具体来说,NanoUPLC-MS E 技术提供了复杂混合物的快速蛋白质分析,并提供了支持的步骤,以实现高样品通量,使用少量样品的鉴定和定量,并具有出色的重复性。在这里,我们使用NanoUPLC-MS E 对大豆种子EMBRAPA BR16栽培品种的肽和蛋白质鉴定及定量进行评估,并与Uniprot数据库中大豆序列的理论胰蛋白酶消化进行比较。

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