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Recursive gene selection based on maximum margin criterion: a comparison with SVM-RFE

机译:基于最大余量准则的递归基因选择:与SVM-RFE的比较

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摘要

Background:In class prediction problems using microarray data, gene selection is essential to improve the prediction accuracy and to identify potential marker genes for a disease. Among numerous existing methods for gene selection, support vector machine-based recursive feature elimination (SVM-RFE) has become one of the leading methods and is being widely used. The SVM-based approach performs gene selection using the weight vector of the hyperplane constructed by the samples on the margin. However, the performance can be easily affected by noise and outliers, when it is applied to noisy, small sample size microarray data.
机译:背景:在使用微阵列数据进行的类预测问题中,基因选择对于提高预测准确性和识别疾病的潜在标记基因至关重要。在众多现有的基因选择方法中,基于支持向量机的递归特征消除(SVM-RFE)已成为领先的方法之一,并被广泛使用。基于SVM的方法使用边缘上样本构成的超平面的权重向量执行基因选择。但是,将其应用于嘈杂的小样本微阵列数据时,性能很容易受到噪声和离群值的影响。

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