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GMFilter and SXTestPlate: software tools for improving the SNPlex™ genotyping system

机译:GMFilter和SXTestPlate:用于改进SNPlex™基因分型系统的软件工具

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摘要

BackgroundGenotyping of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) is a fundamental technology in modern genetics. The SNPlex™ mid-throughput genotyping system (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) enables the multiplexed genotyping of up to 48 SNPs simultaneously in a single DNA sample. The high level of automation and the large amount of data produced in a high-throughput laboratory require advanced software tools for quality control and workflow management.
机译:背景技术单核苷酸多态性(SNP)的基因分型是现代遗传学中的一项基本技术。 SNPlex™中通量基因分型系统(美国加利福尼亚州福斯特城的Applied Biosystems)可在单个DNA样品中同时进行多达48个SNP的多重基因分型。在高通量实验室中,高度的自动化和大量的数据需要用于质量控制和工作流管理的高级软件工具。

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