首页> 美国卫生研究院文献>BMC Bioinformatics >Disentangling evolutionary signals: conservation specificity determining positions and coevolution. Implication for catalytic residue prediction

【2h】

Disentangling evolutionary signals: conservation specificity determining positions and coevolution. Implication for catalytic residue prediction

机译：解开进化信号：保守性特异性决定位置和共同进化。催化残留预测的意义

代理获取

本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

BackgroundA large panel of methods exists that aim to identify residues with critical impact on protein function based on evolutionary signals, sequence and structure information. However, it is not clear to what extent these different methods overlap, and if any of the methods have higher predictive potential compared to others when it comes to, in particular, the identification of catalytic residues (CR) in proteins. Using a large set of enzymatic protein families and measures based on different evolutionary signals, we sought to break up the different components of the information content within a multiple sequence alignment to investigate their predictive potential and degree of overlap.

机译：背景技术存在大量旨在基于进化信号，序列和结构信息来鉴定对蛋白质功能具有关键影响的残基的方法。但是，目前尚不清楚这些不同方法在多大程度上重叠，以及在确定蛋白质中的催化残基（CR）时，是否有任何方法比其他方法具有更高的预测潜力。使用大量的酶蛋白家族和基于不同进化信号的方法，我们试图在多序列比对中分解信息内容的不同组成部分，以研究其预测潜力和重叠程度。

著录项

期刊名称 BMC Bioinformatics
作者
Elin Teppa; Angela D Wilkins; Morten Nielsen; Cristina Marino Buslje;
展开▼
作者单位

展开▼
年(卷),期 2012(13),-1
年度 2012
页码 235
总页数 8
原文格式 PDF
正文语种
中图分类应用微生物学;生化遗传学;生化药理学;
关键词
Coevolution Mutual information Specificity determining position Catalytic residues Functional sites Sequence analysis;

机译：协同进化;互信息;特异性确定位置;催化残基;功能位点;序列分析;

相似文献

外文文献
中文文献
专利

1. Disentangling evolutionary signals: conservation, specificity determining positions and coevolution. Implication for catalytic residue prediction [J] . Elin Teppa, Angela D Wilkins, Morten Nielsen, BMC Bioinformatics . 2012,第1期

机译：解开进化信号：保护，特异性确定位置和参与。催化残留预测的含义
2. Breaking the conservation of guanine residues in the catalytic loop of 10-23 DNAzyme by position-specific nucleobase modifications for rate enhancement [J] . Yang Liu, Zhiwen Li, Gaofeng Liu, Chemical Communications . 2013,第44期

机译：通过位置特异性核碱基修饰来提高速率的方法打破了10-23 DNAzyme催化环中鸟嘌呤残基的保守性
3. Evolutionary patterns and processes in the genus Rosa (Rosaceae) and their implications for host-parasite coevolution. [J] . Wissemann V., Ritz CM Plant Systematics and Evolution . 2007,第1a2期

机译：罗莎（蔷薇科）属的进化模式和过程及其对寄主-寄生虫共进化的影响。
4. Residue-Residue Contact Prediction Based on Evolutionary Computation [C] . Alfonso E. Marquez Chamorro, Federico Divina, Jesus S. Aguilar-Ruiz, 5th international conference on practical applications of computational biology amp; bioinformatics . 2011

机译：基于进化计算的残渣-残渣接触预测
5. Prediction of catalytic site in proteins using support vector machine classifier and conservation of prediction approach. [D] . Petrova, Natalia V. 2008

机译：使用支持向量机分类器预测蛋白质中的催化位点并保留预测方法。
6. Characterization and prediction of the binding site in DNA-binding proteins: improvement of accuracy by combining residue composition evolutionary conservation and structural parameters [O] . Sucharita Dey, Arumay Pal, Mainak Guharoy, 2012

机译：DNA结合蛋白中结合位点的表征和预测：通过结合残基组成进化保守性和结构参数提高准确性
7. Disentangling evolutionary signals: conservation, specificity determining positions and coevolution. Implication for catalytic residue prediction [O] . 2012

机译：解开进化信号：保守性，特异性决定位置和共同进化。催化残留预测的意义

Disentangling evolutionary signals: conservation specificity determining positions and coevolution. Implication for catalytic residue prediction

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅