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首页> 美国卫生研究院文献>BMC Bioinformatics >The Triform algorithm: improved sensitivity and specificity in ChIP-Seq peak finding
【2h】

The Triform algorithm: improved sensitivity and specificity in ChIP-Seq peak finding

机译：Triform算法：提高了ChIP-Seq峰发现的灵敏度和特异性

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BackgroundChromatin immunoprecipitation combined with high-throughput sequencing (ChIP-Seq) is the most frequently used method to identify the binding sites of transcription factors. Active binding sites can be seen as peaks in enrichment profiles when the sequencing reads are mapped to a reference genome. However, the profiles are normally noisy, making it challenging to identify all significantly enriched regions in a reliable way and with an acceptable false discovery rate.
机译：背景染色质免疫沉淀与高通量测序（ChIP-Seq）相结合是鉴定转录因子结合位点最常用的方法。当测序读数被定位到参考基因组时，活性结合位点可被视为富集谱中的峰。但是，这些配置文件通常嘈杂，因此以可靠的方式和可接受的错误发现率来识别所有显着富集的区域具有挑战性。

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