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Distribution Analyzer a methodology for identifying and clustering outlier conditions from single-cell distributions and its application to a Nanog reporter RNAi screen

机译:分布分析器一种从单细胞分布中识别和聚类异常条件的方法并将其应用于Nanog报告RNAi筛选

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摘要

BackgroundChemical or small interfering (si) RNA screens measure the effects of many independent experimental conditions, each applied to a population of cells (e.g., all of the cells in a well). High-content screens permit a readout (e.g., fluorescence, luminescence, cell morphology) from each cell in the population. Most analysis approaches compare the average effect on each population, precluding identification of outliers that affect the distribution of the reporter in the population but not its average. Other approaches only measure changes to the distribution with a single parameter, precluding accurate distinction and clustering of interesting outlier distributions.
机译:背景化学或小干扰(si)RNA筛选可测量许多独立实验条件的影响,每种条件均适用于细胞群(例如孔中的所有细胞)。高含量的屏幕允许从群体中的每个细胞中读出(例如,荧光,发光,细胞形态)。大多数分析方法都会比较对每个人口的平均影响,而不是找出影响报告人在人口中的分布的异常值,而不是影响其平均数的异常值。其他方法仅使用单个参数来测量分布的变化,从而无法进行准确的区分和有趣的异常分布的聚类。

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