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SCIFIO: an extensible framework to support scientific image formats

机译:SCIFIO:支持科学图像格式的可扩展框架

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摘要

BackgroundNo gold standard exists in the world of scientific image acquisition; a proliferation of instruments each with its own proprietary data format has made out-of-the-box sharing of that data nearly impossible. In the field of light microscopy, the Bio-Formats library was designed to translate such proprietary data formats to a common, open-source schema, enabling sharing and reproduction of scientific results. While Bio-Formats has proved successful for microscopy images, the greater scientific community was lacking a domain-independent framework for format translation.
机译:背景技术在科学图像采集领域没有金标准;每种都有自己专有数据格式的仪器的泛滥几乎使现成的数据共享几乎不可能。在光学显微镜领域,生物格式库旨在将此类专有数据格式转换为通用的开源模式,从而实现科学成果的共享和再现。虽然生物格式已被证明可成功用于显微图像,但更大的科学界仍缺乏格式转换的领域无关框架。

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