• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 美国卫生研究院文献>Nucleic Acids Research >PileLineGUI: a desktop environment for handling genome position files in next-generation sequencing studies
【2h】

PileLineGUI: a desktop environment for handling genome position files in next-generation sequencing studies

机译：PILELINELINEGUI：用于下一代测序研究中处理基因组位置文件的桌面环境

代理获取
本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Next-generation sequencing (NGS) technologies are making sequence data available on an unprecedented scale. In this context, new catalogs of Single Nucleotide Polymorphism and mutations generated by resequencing studies are usually stored in genome position files (e.g. Variant Call Format, SAMTools pileup, BED, GFF) comprising of large lists of genomic positions, which are difficult to handle by researchers. Here, we present PileLineGUI, a novel desktop application primarily designed for manipulating, browsing and analysing genome position files (GPF), with specific support to somatic mutation finding studies. The developed tool also integrates a new genome browser module specially designed for inspecting GPFs. PileLineGUI is free, multiplatform and designed to be intuitively used by biomedical researchers. PileLineGUI is available at: .
机译：下一代测序（NGS）技术正在以前所未有的规模提供序列数据。在这种情况下，单核苷酸多态性和通过重测序研究产生的突变的新目录通常存储在基因组位置文件中（例如，变异调用格式，SAMTools堆积，BED，GFF），其中包含大量的基因组位置列表，难以处理研究人员。在这里，我们介绍了PipelineGUI，这是一种新颖的桌面应用程序，主要设计用于操纵，浏览和分析基因组位置文件（GPF），并特别支持体细胞突变发现研究。开发的工具还集成了专门设计用于检查GPF的新基因组浏览器模块。 PipelineGUI是免费的，多平台的，旨在供生物医学研究人员直观使用。您可以在以下位置找到PILELINELINEGUI。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号