• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 美国卫生研究院文献>other >A new Python library to analyse skeleton images confirms malaria parasite remodelling of the red blood cell membrane skeleton
【2h】

A new Python library to analyse skeleton images confirms malaria parasite remodelling of the red blood cell membrane skeleton

机译：一个用于分析骨骼图像的新Python库确认了疟疾寄生虫对红细胞膜骨骼的重塑

代理获取
本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

We present Skan (Skeleton analysis), a Python library for the analysis of the skeleton structures of objects. It was inspired by the “analyse skeletons” plugin for the Fiji image analysis software, but its extensive Application Programming Interface (API) allows users to examine and manipulate any intermediate data structures produced during the analysis. Further, its use of common Python data structures such as SciPy sparse matrices and pandas data frames opens the results to analysis within the extensive ecosystem of scientific libraries available in Python. We demonstrate the validity of Skan’s measurements by comparing its output to the established Analyze Skeletons Fiji plugin, and, with a new scanning electron microscopy (SEM)-based method, we confirm that the malaria parasite Plasmodium falciparum remodels the host red blood cell cytoskeleton, increasing the average distance between spectrin-actin junctions.
机译：我们介绍了Skan（骨架分析），这是一个用于分析对象的骨架结构的Python库。它的灵感来自于斐济图像分析软件的“分析框架”插件，但其广泛的应用程序编程接口（API）允许用户检查和操作分析过程中产生的任何中间数据结构。此外，它使用常见的Python数据结构（例如SciPy稀疏矩阵和熊猫数据框），可以在Python中广泛的科学库生态系统中进行结果分析。我们通过将Skan的输出结果与已建立的Analyze Skeletons Fiji插件进行比较来证明Skan的测量方法的有效性，并使用基于扫描电子显微镜（SEM）的新方法，我们确认疟疾寄生虫恶性疟原虫重塑了宿主红细胞的细胞骨架，增加血影蛋白-肌动蛋白连接之间的平均距离。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号