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Big Data in CryoEM: Automated collection processing and accessibility of EM data

机译：CryoEM中的大数据：EM数据的自动收集处理和可访问性

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摘要

The scope and complexity of cryogenic electron microscopy (cryoEM) data has greatly increased, and will continue to do so, due to recent and ongoing technical breakthroughs that have led to much improved resolutions for macromolecular structures solved using this method. This big data explosion includes single particle data as well as tomographic tilt series, both generally acquired as direct detector movies of ~10–100 frames per image or per tilt-series. We provide a brief survey of the developments leading to the current status, and describe existing cryoEM pipelines, with an emphasis on the scope of data acquisition, methods for automation, and use of cloud storage and computing.
机译：低温电子显微镜（cryoEM）数据的范围和复杂性已经大大增加，并且将继续这样做，这是由于最近和正在进行的技术突破已导致使用此方法解决的大分子结构的分辨率大大提高。这场大数据爆炸包括单个粒子数据以及层析成像倾斜序列，通常都是直接探测器电影获得的每个图像或每个倾斜序列约10–100帧。我们对导致当前状态的发展进行了简短的调查，并描述了现有的cryoEM管道，并着重于数据采集的范围，自动化方法以及云存储和计算的使用。

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