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Faceted Visualization of Three Dimensional Neuroanatomy By Combining Ontology with Faceted Search

机译：结合本体与面搜索的三维神经解剖学面化可视化

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摘要

In this work, we present a faceted-search based approach for visualization of anatomy by combining a three dimensional digital atlas with an anatomy ontology. Specifically, our approach provides a drill-down search interface that exposes the relevant pieces of information (obtained by searching the ontology) for a user query. Hence, the user can produce visualizations starting with minimally specified queries. Furthermore, by automatically translating the user queries into the controlled terminology our approach eliminates the need for the user to use controlled terminology. We demonstrate the scalability of our approach using an abdominal atlas and the same ontology. We implemented our visualization tool on the opensource 3D Slicer software. We present results of our visualization approach by combining a modified Foundational Model of Anatomy (FMA) ontology with the Surgical Planning Laboratory (SPL) Brain 3D digital atlas, and geometric models specific to patients computed using the SPL brain tumor dataset.
机译：在这项工作中，我们通过将三维数字地图集与解剖学本体相结合，提出了一种基于分面搜索的解剖学可视化方法。具体来说，我们的方法提供了一个向下搜索界面，该界面为用户查询提供了相关信息（通过搜索本体而获得）。因此，用户可以从最少指定的查询开始产生可视化效果。此外，通过自动将用户查询转换为受控术语，我们的方法消除了用户使用受控术语的需要。我们演示了使用腹部图谱和相同本体的方法的可扩展性。我们在开源3D Slicer软件上实现了可视化工具。我们通过将改良的解剖学基础模型（FMA）本体与手术计划实验室（SPL）脑3D数字地图集以及使用SPL脑肿瘤数据集计算出的特定于患者的几何模型相结合，提出了可视化方法的结果。

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