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【2h】

Near-cognate suppression of amber opal and quadruplet codons competes with aminoacyl-tRNAPyl for genetic code expansion

机译：琥珀色的近同源抑制琥珀色蛋白石和四点密码子与亚氨基酰基-Trnapyl进行遗传代码扩张

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摘要

Over 300 amino acids are found in proteins in nature, yet typically only 20 are genetically encoded. Reassigning stop codons and use of quadruplet codons emerged as the main avenues for genetically encoding non-canonical amino acids (NCAAs). Canonical aminoacyl-tRNAs with near-cognate anticodons also read these codons to some extent. This background suppression leads to ‘statistical protein’ that contains some natural amino acid(s) at a site intended for NCAA. We characterize near-cognate suppression of amber, opal and a quadruplet codon in common Escherichia coli laboratory strains and find that the PylRS/tRNA^Pyl orthogonal pair cannot completely outcompete contamination by natural amino acids.

机译：在自然界的蛋白质中发现了300多个氨基酸，但通常只有20个是遗传编码的。重新分配终止密码子和使用四联密码子成为遗传编码非规范氨基酸（NCAAs）的主要途径。具有近同源反密码子的典型氨酰基-tRNA也在一定程度上读取了这些密码子。这种背景抑制作用会导致“统计蛋白”在打算用于NCAA的位点包含一些天然氨基酸。我们表征了普通大肠杆菌实验室菌株中琥珀，蛋白石和四联密码子的近同源抑制，发现PylRS / tRNA ^{Pyl 正交对不能完全克服天然氨基酸的污染。}

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期刊名称 other
作者
Patrick O’Donoghue; Laure Prat; Ilka U. Heinemann; Jiqiang Ling; Keturah Odoi; Wenshe R. Liu; Dieter Söll;
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作者单位

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年(卷),期 -1(586),21
年度 -1
页码 3931–3937
总页数 18
原文格式 PDF
正文语种
中图分类
关键词
4-base codon Boc-lysine orthogonal translation systems pyrrolysyl-tRNA synthetase tRNA synthetic biology;

机译：4-碱基密码子;Boc-赖氨酸;正交翻译系统;吡咯基-tRNA合成酶;tRNA;合成生物学;

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专利

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机译：琥珀，蛋白石和四联密码子的近同源抑制与氨酰基-tRNAPyl竞争遗传密码扩展

Near-cognate suppression of amber opal and quadruplet codons competes with aminoacyl-tRNAPyl for genetic code expansion

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