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首页> 美国卫生研究院文献>other >A Comparison of rpoB and 16S rRNA as Markers in Pyrosequencing Studies of Bacterial Diversity
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A Comparison of rpoB and 16S rRNA as Markers in Pyrosequencing Studies of Bacterial Diversity

机译：的rpoB和的16s rRNa的比较作为标记在细菌多样性的焦磷酸测序研究

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摘要

BackgroundThe 16S rRNA gene is the gold standard in molecular surveys of bacterial and archaeal diversity, but it has the disadvantages that it is often multiple-copy, has little resolution below the species level and cannot be readily interpreted in an evolutionary framework. We compared the 16S rRNA marker with the single-copy, protein-coding rpoB marker by amplifying and sequencing both from a single soil sample. Because the higher genetic resolution of the rpoB gene prohibits its use as a universal marker, we employed consensus-degenerate primers targeting the Proteobacteria.

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