• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 美国卫生研究院文献>other >DNA Sequencing by Microchip Electrophoresis Using Mixtures of High-and Low-Molar Mass Poly(NN-dimethylacrylamide) Matrices
【2h】

DNA Sequencing by Microchip Electrophoresis Using Mixtures of High-and Low-Molar Mass Poly(NN-dimethylacrylamide) Matrices

机译：使用高和低摩尔质量聚（NN-二甲基丙烯酰胺）基质的混合物通过芯片电泳进行DNA测序

代理获取
本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Previous studies have reported that mixed molar mass polymer matrices show enhanced DNA sequencing fragment separation compared to matrices formulated from a single average molar mass. Here, we describe a systematic study to investigate the effects of varying the amounts of two different average molar mass polymers on the DNA sequencing ability of poly(N,N-dimethylacrylamide) (pDMA) sequencing matrices in microfluidic chips. Two polydisperse samples of pDMA, with weight-average molar masses of 3.5 MDa and 770 kDa, were mixed at various fractional concentrations while maintaining the overall polymer concentration at 5% (w/v). We show that although the separation of short DNA fragments depends strongly on the overall solution concentration of the polymer, inclusion of the high-molar mass polymer is essential to achieve read lengths of interest (> 400 bases) for many sequencing applications. Our results also show that one of the blended matrices, comprised of 3% 3.5 MDa pDMA and 2% 770 kDa pDMA, yields similar sequencing read lengths (> 520 bases on average) to the high molar mass matrix alone, while also providing a five-fold reduction in zero-shear viscosity. These results indicate that the long read lengths achieved in a viscous, high molar mass polymer matrix are also possible to achieve in a tuned, blended matrix of high and low molar mass polymers with a much lower overall solution viscosity.
机译：先前的研究报道，与由单一平均摩尔质量配制的基质相比，混合摩尔质量的聚合物基质显示出增强的DNA测序片段分离。在这里，我们描述了一项系统研究，以研究改变两种不同平均摩尔质量聚合物的量对微流控芯片中聚（N，N-二甲基丙烯酰胺）（pDMA）测序基质的DNA测序能力的影响。将重均摩尔质量为3.5 MDa和770 kDa的两个pDMA多分散样品以不同的分数浓度混合，同时将总聚合物浓度保持在5％（w / v）。我们显示，尽管短DNA片段的分离在很大程度上取决于聚合物的整体溶液浓度，但对于许多测序应用而言，高分子量聚合物的包含对于实现感兴趣的读取长度（> 400个碱基）至关重要。我们的结果还表明，由3％的3.5 MDa pDMA和2％的770 kDa pDMA组成的混合基质之一，与单独的高摩尔质量基质产生的测序读长度（平均> 520个碱基）相似，同时还提供了五个零剪切粘度降低了两倍。这些结果表明，在高，低摩尔质量聚合物的调合共混基质中，在整体溶液粘度低得多的情况下，在粘性高摩尔质量聚合物基质中获得的长读取长度也是可能的。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号