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【2h】

DDBJ launches a new archive database with analytical tools for next-generation sequence data

机译：DDBJ推出了一个带有用于下一代序列数据分析工具的新存档数据库

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The DNA Data Bank of Japan (DDBJ) ( ) has collected and released 1 701 110 entries/1 116 138 614 bases between July 2008 and June 2009. A few highlighted data releases from DDBJ were the complete genome sequence of an endosymbiont within protist cells in the termite gut and Cap Analysis Gene Expression tags for human and mouse deposited from the Functional Annotation of the Mammalian cDNA consortium. In this period, we started a novel user announcement service using Really Simple Syndication (RSS) to deliver a list of data released from DDBJ on a daily basis. Comprehensive visualization of a DDBJ release data was attempted by using a word cloud program. Moreover, a new archive for sequencing data from next-generation sequencers, the ‘DDBJ Read Archive’ (DRA), was launched. Concurrently, for read data registered in DRA, a semi-automatic annotation tool called the ‘DDBJ Read Annotation Pipeline’ was released as a preliminary step. The pipeline consists of two parts: basic analysis for reference genome mapping and assembly and high-level analysis of structural and functional annotations. These new services will aid users’ research and provide easier access to DDBJ databases.
机译：日本DNA数据库（DDBJ）（）已收集并发布了2008年7月至2009年6月之间的1 701 110个条目/ 1 116 138 614个碱基。从DDBJ释放的一些突出数据是原生质细胞内内共生体的完整基因组序列。从哺乳动物cDNA联盟的功能注释中保存的白蚁肠和帽分析基因表达标签用于人类和小鼠。在此期间，我们使用Really Simple Syndication（RSS）启动了一种新颖的用户公告服务，每天提供从DDBJ释放的数据列表。通过使用词云程序，试图对DDBJ发布数据进行全面可视化。此外，还发布了一个用于下一代测序仪数据测序的新存档，即“ DDBJ Read Archive”（DRA）。同时，对于在DRA中注册的读取数据，作为第一步，发布了一种称为“ DDBJ读取注释管道”的半自动注释工具。该管道包括两个部分：用于参考基因组图谱和装配的基础分析以及对结构和功能注释的高级分析。这些新服务将帮助用户进行研究，并提供对DDBJ数据库的更轻松访问。

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