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Metabolomics and Multi-Omics Integration: A Survey of Computational Methods and Resources

机译：代谢组学和多组学整合：一种计算方法和资源的调查

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摘要

As researchers are increasingly able to collect data on a large scale from multiple clinical and omics modalities, multi-omics integration is becoming a critical component of metabolomics research. This introduces a need for increased understanding by the metabolomics researcher of computational and statistical analysis methods relevant to multi-omics studies. In this review, we discuss common types of analyses performed in multi-omics studies and the computational and statistical methods that can be used for each type of analysis. We pinpoint the caveats and considerations for analysis methods, including required parameters, sample size and data distribution requirements, sources of a priori knowledge, and techniques for the evaluation of model accuracy. Finally, for the types of analyses discussed, we provide examples of the applications of corresponding methods to clinical and basic research. We intend that our review may be used as a guide for metabolomics researchers to choose effective techniques for multi-omics analyses relevant to their field of study.
机译：随着研究人员越来越有能力从多种临床和组学方法大规模收集数据，多组学整合正在成为代谢组学研究的重要组成部分。这就需要代谢组学研究人员加深对与多组学研究相关的计算和统计分析方法的了解。在这篇综述中，我们讨论了在多组学研究中执行的常见分析类型，以及可用于每种类型分析的计算和统计方法。我们指出了分析方法的警告和注意事项，包括所需的参数，样本大小和数据分配要求，先验知识的来源以及模型准确性评估的技术。最后，针对所讨论的分析类型，我们提供了相应方法在临床和基础研究中的应用示例。我们希望我们的评论可以用作代谢组学研究人员选择与其研究领域相关的有效的多组学分析技术的指南。

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