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首页> 美国卫生研究院文献>Mitochondrial DNA. Part B Resources >The complete chloroplast genome of Butomus umbellatus L. and its phylogenetic position
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The complete chloroplast genome of Butomus umbellatus L. and its phylogenetic position

机译：Butomus Umbellatus L的完整叶绿体基因组及其系统发育位置

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Butomus umbellatus, which belongs to Butomaceae, is a plant species typical of littoral communities of river and stream shores. Here, we reported and characterized the complete chloroplast (cp) genome of B. umbellatus and analyzed its phylogenetic position based on the complete cp genome sequences of 10 species within the core Alimatales. The cp genome is 158,107 bp in length, which consists of a large single-copy region (LSC, 88,140 bp； GC content: 34.8%), a small single-copy region (SSC, 19,695 bp; GC content: 30.1%), and a pair of inverted repeat regions (IRs, 25,136 bp; GC content: 42.9%). It harbours 113 unique genes, including 79 protein-coding genes, 30 transfer RNA genes, and 4 ribosomal RNA genes with an overall GC content of 36.8%. The phylogeny inference showed that Butomaceae and Hydrochariaceae formed a high supported clade, which was sister to Alismataceae. This result was similar to the floral development from petaloid Alismatales, and also similar to the phylogenetic studies of Alismales based on 83 plastid genes, but with much higher bootstrap support.
机译：属于Butomaceae的Butomus Umbellatus是一种典型的河流和流海岸典型的植物物种。在这里，我们报道并表征了B.Mubellatus的完整叶绿体（CP）基因组，并基于核心含有核酸内核心的完整CP基因组序列分析其系统发育位置。 CP基因组的长度为158,107bp，由大型单拷贝区域（LSC，88,140bp; GC含量：34.8％），一个小单拷贝区域（SSC，19,695 BP; GC含量：30.1％），和一对倒置的重复区域（IRS，25,136 BP; GC含量：42.9％）。它是113个独特的基因，包括79个蛋白质编码基因，30转移RNA基因和4个核糖体RNA基因，总GC含量为36.8％。系统发生的推理表明，Butomaceae和氢丙藻形成了高负支持的疏水膜，is is到alismataceae。该结果与木肺铝质铝质的花卉发育类似，并且还类似于基于83个塑性基因的壁球的系统发育研究，但是具有更高的举止举止支持。

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