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首页> 美国卫生研究院文献>Mitochondrial DNA. Part B Resources >The complete chloroplast genome and phylogenetic analysis of Syringa reticulata subsp. amurensis (Rupr.) P.S.Green M.C.Chang from Qinghai Province China
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The complete chloroplast genome and phylogenetic analysis of Syringa reticulata subsp. amurensis (Rupr.) P.S.Green M.C.Chang from Qinghai Province China

机译：紫杉孢菌菌的完整叶绿体基因组和系统发育分析。 Amurensis（Rupr。）P.S.Green＆M.C.Chang来自中国青海省

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Syringa reticulata subsp. amurensis (Rupr.) P. S. Green & M. C. Chang (Oleaceae) is a shrub or tree with high medicinal value as well as great ecological significance as an urban garden plant. To better understand the molecular genetics and evolutionary of S. reticulata subsp. amurensis, its complete chloroplast genome was sequenced and annotated. The assembled chloroplast genome is a circular 156,141 bp sequence, consisting of 87,108 bp large single copy (LSC) region and 17,239 bp small single copy (SSC) region, which were flanked by a pair of 25,897 bp inverted repeats (IRs). The GC content of the chloroplast genome is 36.14%. Moreover, a total of 132 functional genes were annotated, including 88 protein-coding, 36 tRNA, and eight rRNA genes. Phylogenetic analysis showed that S. reticulata subsp. amurensis was most closely related to S. reticulata subsp. Pekinensis and the genus Syringa is paraphyletic group. This study provides important information for further phylogenetic studies on S. reticulata subsp. amurensis and its allies.
机译：紫杉角reticulata subsp。 Amurensis（Rupr。）P. S. Green＆M. C. chang（oleaceae）是一种灌木或树，具有高药物价值，以及作为城市园林植物的巨大生态意义。为了更好地了解S. Reticulata Subsp的分子遗传学和进化。 Amurensis，其完全叶绿体基因组被测序并注释。组装的叶绿体基因组是圆形的156,141bp序列，由87,108bp大单拷贝（LSC）区域和17,239bp小单拷贝（SSC）区域组成，其侧翼为一对25,897bp倒反转的重复（IRS）。叶绿体基因组的GC含量为36.14％。此外，共注释了总共132个官能基因，包括88个蛋白质编码，36tRNA和八个rRNA基因。系统发育分析表明S. Retictulata Subsp。 Amurensis与S. Reticulata Subsp最密切相关。 pekinensis和丁香属是助理群。本研究为S. Reticulata SubsP提供了进一步的系统发育研究的重要信息。 Amurensis及其盟友。

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