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首页> 美国卫生研究院文献>Virologica Sinica >Genotyping of white spot syndrome virus in Chinese cultured shrimp during 1998–1999
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Genotyping of white spot syndrome virus in Chinese cultured shrimp during 1998–1999

机译：1998 - 1999年中国培养虾白斑综合征病毒的基因分型

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摘要

Recent studies showed that white spot syndrome virus (WSSV) isolates from different geographic locations share a high genetic similarity except the variable regions in ORF23/24 and ORF14/15, and variable number of tandem repeats (VNTR) within ORF94. In this study, genotyping was performed according to these three variable regions among WSSV isolates collected during 1998/1999 from Southern China. These WSSV isolates contain a deletion of 1168, 5657, 5898, 9316 and 11093 bp, respectively in the variable region ORF23/24 compared with WSSV-TW, and a deletion of 4749 or 5622 bp in the variable region ORF14/15 relative to TH-96-II. Four types of repeat units (RUs) (6, 8, 9 and 13 RUs) in ORF94 were detected in these isolates, with the shortest 6 RUs as the most prevalent type. Our results provide important information for a better understanding of the spatio-temporal transmission mode and the WSSV genetic evolution lineage.
机译：最近的研究表明，除了ORF23 / 24和ORF14 / 15的可变区和ORF94内的可变数量，除了不同地理位点的白斑综合征病毒（WSSV）分离株存在高遗传相似性，以及ORF94内的可变数量的串联重复（VNTR）。在该研究中，基因分型根据来自中国南部1998/1999期间收集的WSSV分离物中的这三个可变区进行。这些WSSV分离物在与WSSV-TW相比，分别在可变区orf23 / 24中分别缺失1168,5657,5898,9316和11093bp，以及相对于th的可变区ORF14 / 15中的4749或5622bp的缺失-96-II。在这些分离物中检测到ORF94中的四种类型的重复单元（6,8,9和13 rus），最短6卢比作为最普遍的类型。我们的结果提供了更好地理解时空传输模式和WSSV遗传演化谱系的重要信息。

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