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首页> 美国卫生研究院文献>Journal of Cheminformatics >Experimental validation of FINDSITEcomb virtual ligand screening results for eight proteins yields novel nanomolar and micromolar binders
【2h】

Experimental validation of FINDSITEcomb virtual ligand screening results for eight proteins yields novel nanomolar and micromolar binders

机译：FINDSITEcomb虚拟配体筛选八种蛋白质的结果的实验​​验证产生了新型的纳摩尔和微摩尔结合剂

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BackgroundIdentification of ligand-protein binding interactions is a critical step in drug discovery. Experimental screening of large chemical libraries, in spite of their specific role and importance in drug discovery, suffer from the disadvantages of being random, time-consuming and expensive. To accelerate the process, traditional structure- or ligand-based VLS approaches are combined with experimental high-throughput screening, HTS. Often a single protein or, at most, a protein family is considered. Large scale VLS benchmarking across diverse protein families is rarely done, and the reported success rate is very low. Here, we demonstrate the experimental HTS validation of a novel VLS approach, FINDSITEcomb, across a diverse set of medically-relevant proteins.
机译：背景技术配体-蛋白质结合相互作用的鉴定是药物开发中的关键步骤。尽管大型化学文库在药物发现中具有特殊作用和重要性，但对它们进行实验筛选的缺点是随机，费时且昂贵。为了加速这一过程，传统的基于结构或配体的VLS方法与实验性高通量筛选HTS相结合。通常考虑单个蛋白质或最多蛋白质家族。很少进行跨各种蛋白质家族的大规模VLS基准测试，并且报道的成功率非常低。在这里，我们展示了一种新颖的VLS方法FINDSITE comb 在多种与医学相关的蛋白质上的实验性HTS验证。

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