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【24h】

Cerebral: a Cytoscape plugin for layout of and interaction with biological networks using subcellular localization annotation

机译：脑：Cytoscape插件，用于使用亚细胞定位注释对生物网络进行布局并与之交互

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Summary: Cerebral (Cell Region-Based Rendering And Layout) is an open-source Java plugin for the Cytoscape biomolecular interaction viewer. Given an interaction network and subcellular localization annotation, Cerebral automatically generates a view of the network in the style of traditional pathway diagrams, providing an intuitive interface for the exploration of a biological pathway or system. The molecules are separated into layers according to their subcellular localization. Potential products or outcomes of the pathway can be shown at the bottom of the view, clustered according to any molecular attribute data—protein function—for example. Cerebral scales well to networks containing thousands of nodes.
机译：简介：脑（基于单元区域的渲染和布局）是Cytoscape生物分子相互作用查看器的开源Java插件。给定一个交互网络和亚细胞定位注释，Cerebral会自动以传统路径图的样式生成网络视图，从而为探索生物路径或系统提供直观的界面。分子根据其亚细胞定位分为几层。该途径的潜在产物或结果可以显示在视图的底部，根据任何分子属性数据（例如蛋白质功能）进行聚类。脑可以很好地扩展到包含数千个节点的网络。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2007年第8期|1040-1042|共3页
  • 作者

    Aaron Barsky; Jennifer L. Gardy; Robert E. W. Hancock; and Tamara Munzner;

  • 作者单位

    Department of Computer Science and;

    Centre for Microbial Diseases and Immunity Research University of British Columbia Vancouver British Columbia V6T 1Z4 Canada;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
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