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The Roche Cancer Genome Database 2.0

机译：罗氏癌症基因组数据库2.0

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Background Cancer is a disease of genome alterations that arise through the acquisition of multiple somatic DNA sequence mutations. Some of these mutations can be critical for the development of a tumor and can be useful to characterize tumor types or predict outcome. Description We have constructed an integrated biological information system termed the Roche Cancer Genome Database (RCGDB) combining different human mutation databases already publicly available. This data is further extended by hand-curated information from publications. The current version of the RCGDB provides a user-friendly graphical interface that gives access to the data in different ways: (1) Single interactive search by genes, samples, cell lines, diseases, as well as pathways, (2) batch searches for genes and cell lines, (3) customized searches for regularly occurring requests, and (4) an advanced query interface enabling the user to query for samples and mutations by various filter criteria. Conclusion The interfaces of the presented database enable the user to search and view mutations in an intuitive and straight-forward manner. The database is freely accessible at http://?rcgdb.?bioinf.?uni-sb.?de/?MutomeWeb/? .
机译：背景技术癌症是通过获取多个体细胞DNA序列突变而引起的基因组改变的疾病。这些突变中的一些对于肿瘤的发展可能至关重要，并且可用于表征肿瘤类型或预测结果。描述我们已经构建了一个综合的生物信息系统，称为罗氏癌症基因组数据库（RCGDB），它结合了已经公开可用的各种人类突变数据库。这些数据通过出版物的手工整理信息得到进一步扩展。当前版本的RCGDB提供了一个用户友好的图形界面，该界面以不同的方式访问数据：（1）按基因，样品，细胞系，疾病和途径进行的单个交互式搜索，（2）批量搜索基因和细胞系;（3）对定期出现的请求进行自定义搜索;（4）高级查询界面，使用户能够通过各种过滤条件查询样品和突变。结论所提供数据库的界面使用户能够以直观，直接的方式搜索和查看突变。可从http：//？rcgdb。？bioinf。？uni-sb。？de /？MutomeWeb /？免费访问该数据库。 。

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