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【24h】

{RECONSTRUCTION} {OF} {SAXS} {PROFILES} {FROM} {PROTEIN} {STRUCTURES}

机译:{RECONSTRUCTION} {OF} {SAXS} {PROFILES} {FROM} {PROTEIN} {STRUCTURES}

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摘要

Small angle X-ray scattering (SAXS) is used for low resolution structural characterization of proteins often in combination with other experimental techniques. After briefly reviewing the theory of {SAXS} we discuss computational methods based on 1) the Debye equation and 2) Spherical Harmonics to compute intensity profiles from a particular macromolecular structure. Further, we review how these formulas are parameterized for solvent density and hydration shell adjustment. Finally we introduce our solution to compute {SAXS} profiles utilizing {GPU} acceleration.
机译:小角度X射线散射(SAXS)通常与其他实验技术结合用于蛋白质的低分辨率结构表征。在简要回顾{SAXS}的理论之后,我们讨论基于1)德拜方程和2)球谐函数的计算方法,以根据特定的大分子结构计算强度分布。此外,我们回顾了如何针对溶剂密度和水合壳层调整对这些公式进行参数化。最后,我们介绍了利用{GPU}加速来计算{SAXS}配置文件的解决方案。

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