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首页> 外文期刊>Computational Methods in Science and Technologygy >Porting the OPATM-BFM Application to a Grid e-Infrastructure – Optimization of Communication and I/O Patterns
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Porting the OPATM-BFM Application to a Grid e-Infrastructure – Optimization of Communication and I/O Patterns

机译：将OPATM-BFM应用程序移植到网格电子基础设施–通信和I / O模式的优化

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OPATM-BFM is an off-line three-dimensional coupled eco-hydrodynamic simulation model used for biogeochemical and ecosystem-level predictions. This paper presents the first results of research activities devoted to the adaptation of the parallel OPATMBFM application for an efficient usage in modern Grid-based e-Infrastructures. For the application performance on standard Grid architectures providing generic clusters of workstations, such results are important. We propose a message-passing analysis technique for communication-intensive parallel applications based on a preliminary application run analysis. This technique was successfully used for the OPATM-BFM application and allowed us to identify several optimization proposals for the current realization of the communication pattern. As the suggested improvements are quite generic, they can be potentially useful for other parallel scientific applications.
机译：OPATM-BFM是用于生物地球化学和生态系统水平预测的离线三维耦合生态水动力模拟模型。本文介绍了致力于将并行OPATMBFM应用程序改编为在现代基于网格的电子基础架构中有效使用的研究活动的第一批结果。对于提供通用工作站集群的标准Grid体系结构上的应用程序性能而言，这样的结果很重要。我们基于初步的应用程序运行分析，为通信密集型并行应用程序提出了一种消息传递分析技术。该技术已成功用于OPATM-BFM应用，并允许我们为当前实现的通信模式确定一些优化建议。由于建议的改进非常通用，因此它们可能对其他并行科学应用很有用。

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