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KID Project: an internet-based digital video atlas of capsule endoscopy for research purposes

机译：KID项目：用于研究目的的基于互联网的胶囊内窥镜数字视频图集

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Background and aims Capsule endoscopy (CE) has revolutionized small-bowel (SB) investigation. Computational methods can enhance diagnostic yield (DY); however, incorporating machine learning algorithms (MLAs) into CE reading is difficult as large amounts of image annotations are required for training. Current databases lack graphic annotations of pathologies and cannot be used. A novel database, KID, aims to provide a reference for research and development of medical decision support systems (MDSS) for CE. Methods Open-source software was used for the KID database. Clinicians contribute anonymized, annotated CE images and videos. Graphic annotations are supported by an open-access annotation tool (Ratsnake). We detail an experiment based on the KID database, examining differences in SB lesion measurement between human readers and a MLA. The Jaccard Index (JI) was used to evaluate similarity between annotations by the MLA and human readers. Results The MLA performed best in measuring lymphangiectasias with a JI of 81?±?6?%. The other lesion types were: angioectasias (JI 64?±?11?%), aphthae (JI 64?±?8?%), chylous cysts (JI 70?±?14?%), polypoid lesions (JI 75?±?21?%), and ulcers (JI 56?±?9?%). Conclusion MLA can perform as well as human readers in the measurement of SB angioectasias in white light (WL). Automated lesion measurement is therefore feasible. KID is currently the only open-source CE database developed specifically to aid development of MDSS. Our experiment demonstrates this potential. * KID working group
机译：背景和目的胶囊内窥镜（CE）彻底改变了小肠（SB）的研究。计算方法可以提高诊断率（DY）。但是，将机器学习算法（MLA）纳入CE读取非常困难，因为培训需要大量的图像注释。当前的数据库缺少病理的图形注释，因此无法使用。一个新颖的数据库KID旨在为CE医疗决策支持系统（MDSS）的研究和开发提供参考。方法KID数据库使用开源软件。临床医生会提供匿名的，带注释的CE图像和视频。开放注释工具（Ratsnake）支持图形注释。我们详细介绍了基于KID数据库的实验，研究了人类读者与MLA之间SB病变测量的差异。雅卡索引（JI）用于评估MLA和人类读者在注释之间的相似性。结果MLA在测量淋巴管扩张方面表现最好，JI为81？±？6？％。其他病变类型为：血管扩张（JI 64±±11％），口疮（JI 64±±8％），乳腺囊肿（JI 70±±14％），息肉状病变（JI 75±±）。 （21％）和溃疡（JI 56±9％）。结论在白光（WL）中SB血管扩张的测量中，MLA的表现与人类读者一样好。因此，自动病变测量是可行的。 KID是当前唯一专门开发用于帮助MDSS开发的开源CE数据库。我们的实验证明了这种潜力。 * KID工作组

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