Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis

Xin Zhao; Huiyong Zhang; Lei Li

首页> 外文期刊>Genomics >Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis

【24h】

Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis

机译：拟南芥microRNA基因近端启动子的鉴定与分析

获取原文

掌桥外文数据库（机构版） >>

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

EndogenousmicroRNAs(miRNAs)modulategeneexpressionatthepost-transcriptionlevel.Inplants,avastmajorityofemMIR/emgenesarethoughttobetranscribedbyRNAPolymeraseII(PolII).However,promoterorganizationiscurrentlyunknownformostplantemMIR/emgenes.ThisdeficiencypreventsacomprehensiveunderstandingofmiRNA-mediatedgenenetworks.Inthisstudy,weperformedPolIIchromatinimmunoprecipitation(ChIP)analysisinemArabidopsis/emusingagenometilingmicroarray.DistinctPolIIbindingwasfoundatmostemMIR/emloci,whichallowedpredictionofthetranscriptionstartsites(TSSs)for167emMIR/emgenesinemArabidopsis/emthatwasvalidatedbyaveragefreeenergyprofiling.Byemploying99positionweightmatrices(PWM),wesystematicallyscannedtheregulatoryregionsupstreamoftheTSSs.Wediscoveredelevenandtencis-elementsthatarestatisticallyover-andunder-representedinemMIR/empromoters,respectively.Thus,analysisofPolIIbindingprovidesanewperspectiveforstudyingmiRNAsinplants./p/div

机译：内源性microRNA（miRNA）在转录后水平上调节基因表达。植物中，大多数 MIR 基因应被RNA聚合酶II（PolII）鉴定。然而，目前大多数植物 M P均认为这种表达不足的原因是这种植物缺乏免疫力。 >拟南芥使用无突变的微阵列。在 MIR 位置上发现了明显的PolII结合，这可以预测通过平均自由度的能量分布在整个系统上的平均能量分布，通过调制器对整个系统的平均权重进行校正，在拟南芥中的167 MIR 基因在拟南芥中的转录起始位点。我们分别发现了 MIR 启动子上统计上高于和低于代表的十一和十个元素。因此，PolII结合分析为植物中miRNA的研究提供了新的视角。 展开▼

著录项

来源
《Genomics》 |2013年第3期|共页

作者
Xin Zhao; Huiyong Zhang; Lei Li;
展开▼

作者单位

展开▼

收录信息

原文格式 PDF

正文语种

中图分类医学遗传学;

关键词

相似文献

外文文献

中文文献

专利

1. Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis [J] . ZhaoX., ZhangH., LiL. Genomics . 2013,第3期

机译：拟南芥microRNA基因近端启动子的鉴定与分析

2. Identification of the transcriptional promoters in the proximal regions of human microRNA genes [J] . Yue-Sheng Long, Guang-Fei Deng, Xun-Sha Sun, Molecular Biology Reports . 2011,第6期

机译：鉴定人类microRNA基因近端区域中的转录启动子

3. Identification of the transcriptional promoters in the proximal regions of human microRNA genes. [J] . Long YS, Deng GF, Sun XS, Molecular biology reports . 2011,第6期

机译：鉴定人类microRNA基因近端区域中的转录启动子。

4. Computational Characterization and Identification of Core Promoters of MicroRNA Genes in C. elegans , H. sapiens and A. thaliana [C] . Xuefeng Zhou, Jianhua Ruan, Guandong Wang, Joint Annual RECOMB Satellite Workshop on Systems Biology and Regulatory Genomics . 2007

机译：C.秀丽隐塞，H. Sapiens和A. Thaliana的微瘤基因核心启动子的计算表征及鉴定

5. Analysis of the cis-Regulatory Element Lexicon in Upstream Gene Promoters of Arabidopsis thaliana and Oryza sativa [D] . Khalil, Belan M. 2018

机译：拟南芥和奥里扎苜蓿瘤瘤瘤基因启动子顺式调节元素词典分析

6. Comparative Analysis of MicroRNA Promoters in Arabidopsis and Rice [O] . Xin Zhao, Lei Li 2013

机译：拟南芥和水稻中MicroRNA启动子的比较分析

7. Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis [O] . Zhao Xin, Zhang Huiyong, Li Lei 2013

机译：拟南芥microRNA基因近端启动子的鉴定与分析

1. 唐鱼β-actin基因近端和远端启动子的鉴定及其启动活性分析 [J] . 王海英 ,叶星 ,劳海华 . 生物工程学报 . 2008,第010期

2. 人β1整合素近端和远端启动子报告基因载体的构建和鉴定及启动活性分析 [J] . 陈卫 ,苏踊跃 ,梁光萍 . 医学研究生学报 . 2007,第002期

3. 拟南芥HGO基因启动子与GUS融合表达载体的构建及转化鉴定 [J] . 蔡薇 ,支添添 ,任春梅 . 作物研究 . 2017,第003期

4. 拟南芥 CWINV1启动子 GUS 表达载体构建及转基因植株的鉴定 [J] . 程姣 ,黄弈 ,任春梅 . 作物研究 . 2016,第003期

5. 拟南芥AtHAK5基因启动子顺式作用元件功能域的鉴定 [J] . 王欣 ,杨菊 ,祁智 . 华北农学报 . 2013,第006期

6. 农杆菌介导的拟南芥AtMIPS基因启动子片段的克隆、序列分析及转基因植株的获得 [C] . 宋颖琦 ,杨谦 . 第十届微生物教学和科研及成果产业化学术研讨会 . 2005

7. 拟南芥胁迫诱导microRNA的分离和功能研究及microRNA启动子分析 [A] . 田鑫 . 2009

1. 一种拟南芥热诱导基因启动子及其在作物改良中的应用 [P] . 中国专利： CN112251437B . 2022.02.01

2. 大豆基因启动子pRPS28和pRPS28-I在大豆、拟南芥及烟草中的应用 [P] . 中国专利： CN113462690A . 2021-10-01

3. Protein 1,4-β- end glucanase genes, and promoters isolated from (Arabidopsis thaliana) Arabidopsisthaliana and transgenic plants of varying morphology [P] . 外国专利： JP2001512672A . 2001-08-28

机译：蛋白质1,4-β-末端葡聚糖酶基因以及从（拟南芥）拟南芥和不同形态的转基因植物中分离的启动子

4. METHOD FOR THE ISOLATION AND / OR TESTING OF GENES AND PROMOTERS INVOLVED IN PLANT-NEMATODE INTERACTIONS USING PLANTS OF THE GENE ARABIDOPSIS. [P] . 外国专利： ES2090618T3 . 1996-10-16

机译：分离和/或测试使用基因型拟南芥植物参与植物-线虫相互作用的基因和启动子的方法。

5. Method for isolating and / or testing genes and promoters for plant-nematoda interaction using plants of the genus Arabidopsis [P] . 外国专利： JP3354929B2 . 2002-12-09

机译：使用拟南芥属植物分离和/或测试基因和启动子的植物-线虫相互作用的方法

相关主题

Identification and analysis of the proximal promoters of microRNA genes in Arabidopsis

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅