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【24h】

Draft genome sequence of Micromonospora sp. DSW705 and distribution of biosynthetic gene clusters for depsipeptides bearing 4-amino-2,4-pentadienoate in actinomycetes

机译：草拟单孢菌种的基因组序列草案。 DSW705和放线菌中带有4-氨基-2,4-戊二烯酸酯的十肽的生物合成基因簇的分布

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Here, we report the draft genome sequence of Micromonospora sp. DSW705 (=NBRC 110037), a producer of antitumor cyclic depsipeptides rakicidins A and B, together with the features of this strain and generation, annotation, and analysis of the genome sequence. The 6.8?Mb genome of Micromonospora sp. DSW705 encodes 6,219 putative ORFs, of which 4,846 are assigned with COG categories. The genome harbors at least three type I polyketide synthase (PKS) gene clusters, one nonribosomal peptide synthetase (NRPS) gene clusters, and three hybrid PKS/NRPS gene clusters. A hybrid PKS/NRPS gene cluster encoded in scaffold 2 is responsible for rakicidin synthesis. DNA database search indicated that the biosynthetic gene clusters for depsipeptides bearing 4-amino-2,4-pentadienoate are widely present in taxonomically diverse actinomycetes.
机译：在这里，我们报告了Micromonospora sp。的基因组序列草图。 DSW705（= NBRC 110037）是抗肿瘤环状双缩肽rakicidins A和B的产生者，以及该菌株的特征以及基因组序列的生成，注释和分析。 Micromonospora sp。的6.8？Mb基因组。 DSW705编码6,219个推定的ORF，其中4,846个被分配了COG类别。该基因组包含至少三个I型聚酮化合物合酶（PKS）基因簇，一个非核糖体肽合成酶（NRPS）基因簇和三个杂交PKS / NRPS基因簇。支架2中编码的杂种PKS / NRPS基因簇负责rakicidin的合成。 DNA数据库搜索表明，带有4-氨基-2,4-戊二烯酸酯的十肽的生物合成基因簇广泛存在于分类学上多样化的放线菌中。

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