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Complete genome of Nitrosospira briensis C-128, an ammonia-oxidizing bacterium from agricultural soil

机译：农业土壤中一种氨氧化细菌Britrosospira briensis C-128的完整基因组

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Nitrosospira briensis C-128 is an ammonia-oxidizing bacterium isolated from an acid agricultural soil. N. briensis C-128 was sequenced with PacBio RS technologies at the DOE-Joint Genome Institute through their Community Science Program (2010). The high-quality finished genome contains one chromosome of 3.21?Mb and no plasmids. We identified 3073 gene models, 3018 of which are protein coding. The two-way average nucleotide identity between the chromosomes of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 and Nitrosospira briensis C-128 was found to be 77.2?%. Multiple copies of modules encoding chemolithotrophic metabolism were identified in their genomic context. The gene inventory supports chemolithotrophic metabolism with implications for function in soil environments.
机译：Britrosodium briensis C-128是一种从酸性农业土壤中分离出来的氨氧化细菌。通过DOE-Joint Genome Institute的社区科学计划（2010年），使用PacBio RS技术对N. briensis C-128进行了测序。高质量的完整基因组包含一个3.21？Mb染色体，没有质粒。我们鉴定了3073个基因模型，其中3018个是蛋白质编码的。发现多形硝化螺旋体ATCC 25196和布里氏硝化螺旋体C-128的染色体的双向平均核苷酸同一性为77.2％。在其基因组背景下鉴定了编码化学营养型代谢的模块的多个副本。基因清单支持化学营养型代谢，影响土壤环境中的功能。

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