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【24h】

JBioWH: an open-source Java framework for bioinformatics data integration

机译：JBioWH：用于生物信息学数据集成的开源Java框架

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The Java BioWareHouse (JBioWH) project is an open-source platform-independent programming framework that allows a user to build his/her own integrated database from the most popular data sources. JBioWH can be used for intensive querying of multiple data sources and the creation of streamlined task-specific data sets on local PCs. JBioWH is based on a MySQL relational database scheme and includes JAVA API parser functions for retrieving data from 20 public databases (e.g. NCBI, KEGG, etc.). It also includes a client desktop application for (non-programmer) users to query data. In addition, JBioWH can be tailored for use in specific circumstances, including the handling of massive queries for high-throughput analyses or CPU intensive calculations. The framework is provided with complete documentation and application examples and it can be downloaded from the Project Web site at http://code.google.com/p/jbiowh. A MySQL server is available for demonstration purposes at hydrax.icgeb.trieste.it:3307. Database URL: http://code.google.com/p/jbiowh
机译：Java BioWareHouse（JBioWH）项目是一个独立于平台的开源平台，允许用户从最受欢迎的数据源中构建自己的集成数据库。 JBioWH可用于密集查询多个数据源以及在本地PC上创建简化的特定于任务的数据集。 JBioWH基于MySQL关系数据库方案，并包含JAVA API解析器功能，可从20个公共数据库（例如NCBI，KEGG等）中检索数据。它还包括一个客户端桌面应用程序，供（非程序员）用户查询数据。此外，JBioWH可以针对特定情况进行量身定制，包括处理用于高通量分析或CPU密集型计算的大量查询。该框架提供了完整的文档和应用程序示例，可以从Project网站（http://code.google.com/p/jbiowh）下载该框架。可以在hydrax.icgeb.trieste.it:3307上使用MySQL服务器进行演示。数据库网址：http://code.google.com/p/jbiowh

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