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MorusDB: a resource for mulberry genomics and genome biology

机译：MorusDB：桑树基因组学和基因组生物学的资源

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Mulberry is an important cultivated plant that has received the attention of biologists interested in sericulture and plant–insect interaction. Morus notabilis, a wild mulberry species with a minimal chromosome number is an ideal material for whole-genome sequencing and assembly. The genome and transcriptome of M. notabilis were sequenced and analyzed. In this article, a web-based and open-access database, the Morus Genome Database (MorusDB), was developed to enable easy-to-access and data mining. The MorusDB provides an integrated data source and an easy accession of mulberry large-scale genomic sequencing and assembly, predicted genes and functional annotations, expressed sequence tags (ESTs), transposable elements (TEs), Gene Ontology (GO) terms, horizontal gene transfers between mulberry and silkworm and ortholog and paralog groups. Transcriptome sequencing data for M. notabilis root, leaf, bark, winter bud and male flower can also be searched and downloaded. Furthermore, MorusDB provides an analytical workbench with some built-in tools and pipelines, such as BLAST, Search GO, Mulberry GO and Mulberry GBrowse, to facilitate genomic studies and comparative genomics. The MorusDB provides important genomic resources for scientists working with mulberry and other Moraceae species, which include many important fruit crops. Designed as a basic platform and accompanied by the SilkDB, MorusDB strives to be a comprehensive platform for the silkworm–mulberry interaction studies. Database URL: http://morus.swu.edu.cn/morusdb.
机译：桑树是一种重要的栽培植物，受到了对养蚕和植物-昆虫相互作用感兴趣的生物学家的关注。 Morus notabilis是一种具有最小染色体数的野生桑树种，是用于全基因组测序和组装的理想材料。对Notabilis的基因组和转录组进行测序和分析。在本文中，开发了基于Web的开放访问数据库Morus基因组数据库（MorusDB），以实现易于访问和数据挖掘的目的。 MorusDB提供了一个集成的数据源，可轻松访问桑树大规模基因组测序和装配，预测的基因和功能注释，表达的序列标签（EST），转座因子（TE），基因本体论（GO）术语，水平基因转移在桑蚕和蚕以及直系同源物和旁系同源物之间。也可以搜索和下载芥末根，叶，树皮，冬芽和雄花的转录组测序数据。此外，MorusDB提供了一个分析工作台，其中包含一些内置工具和管道，例如BLAST，Search GO，Mulberry GO和Mulberry GBrowse，以促进基因组研究和比较基因组学。 MorusDB为从事桑树和其他桑科物种的科学家提供了重要的基因组资源，其中包括许多重要的水果作物。 MorusDB被设计为一个基本平台，并由SilkDB陪同，力争成为蚕桑互动研究的综合平台。数据库URL：http：//morus.swu.edu.cn/morusdb。

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