Genomic and Phylogenetic Analysis of Hepatitis C Virus Isolates from Argentine Patients: a Six-Year Retrospective Study

J. F. Quarleri; B. H. Robertson; V. L. Mathet; M. Feld; L. Esp??nola; M. P. Requeijo

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Genomic and Phylogenetic Analysis of Hepatitis C Virus Isolates from Argentine Patients: a Six-Year Retrospective Study

机译：阿根廷患者丙型肝炎病毒分离株的基因组学和系统发育分析：六年回顾性研究。

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Typing of hepatitis C virus (HCV) isolates from Argentine patients was performed by using different methodologies in a population of 243 patients. HCV subtype was assigned based upon restriction fragment length polymorphism (RFLP). HCV RNA genomes obtained from serum samples were classified as belonging to clade 1 (53.5%), 2 (23.0%), or 3 (8.6%); 14.8% of samples showed HCV mixed infections, more frequently implying different subtypes within the same clade. In addition to RFLP typing, phylogenetic relatedness among sequences from both 5′ untranslated region (n = 50) and nonstructural 5B coding region (n = 15) was established.

机译：对来自阿根廷患者的丙型肝炎病毒（HCV）分离株进行分型，方法是对243名患者使用不同方法。 HCV亚型是根据限制性片段长度多态性（RFLP）分配的。从血清样品中获得的HCV RNA基因组被分为第1类（53.5％），第2类（23.0％）或第3类（8.6％）。 14.8％的样本显示出HCV混合感染，更频繁地暗示着同一进化枝中的不同亚型。除了RFLP分型，还建立了来自5'非翻译区（ n = 50）和非结构性5B编码区（ n = 15）的序列之间的系统发育关系。 展开▼

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来源
《Journal of Clinical Microbiology》 |2000年第12期|共12页

作者
J. F. Quarleri; B. H. Robertson; V. L. Mathet; M. Feld; L. Esp??nola; M. P. Requeijo;
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正文语种

中图分类医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）;

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