Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay

Gavin Cloherty; Neil Parkin; James Rhoads; Claudia Esping; Corklin Steinhart; George Schneider; Lily Yuen; John Hackett

首页> 外文期刊>Journal of Clinical Microbiology >Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay

【24h】

Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay

机译：雅培实时HCV病毒载量测定法靶向的区域的序列保守性

获取原文

掌桥外文数据库（机构版） >>

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

The Abbott RealTime (RT) HCV assay targets the 5′ untranslated region (UTR) of the HCV genome. Here, we analyzed the sequence variability of the assay target regions from 1,092 specimens. Thermodynamic modeling of the percentage of primers/probes bound at the assay annealing temperature was performed to assess the potential effect of sequence variability. An analysis of this large data set revealed that the primer and probe binding sites of the RealTime HCV viral load assay are highly conserved and that naturally occurring sequence polymorphisms are not expected to discernibly impact assay performance.

机译：雅培RealTi m e（RT）HCV检测针对HCV基因组的5'非翻译区（UTR）。在这里，我们分析了来自1,092个标本的分析目标区域的序列变异性。对在测定退火温度下结合的引物/探针的百分比进行热力学建模，以评估序列变异性的潜在影响。对大量数据的分析显示，RealTi m e HCV病毒载量测定的引物和探针结合位点高度保守，自然发生的序列多态性预计不会明显影响测定性能。 展开▼

著录项

来源
《Journal of Clinical Microbiology》 |2014年第4期|共2页

作者
Gavin Cloherty; Neil Parkin; James Rhoads; Claudia Esping; Corklin Steinhart; George Schneider; Lily Yuen; John Hackett;
展开▼

作者单位

展开▼

收录信息

原文格式 PDF

正文语种

中图分类医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）;

关键词

相似文献

外文文献

中文文献

专利

1. Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HBV Viral Load Assay in Clinical Specimens [J] . Gavin A. Cloherty, James Rhoads, Thomas P. Young, Journal of Clinical Microbiology . 2013,第4期

机译：雅培实时HBV病毒载量测定法在临床标本中靶向区域的序列保守性

2. Minimal sequence variability of the region of HIV-1 integrase targeted by the Abbott RealTime HIV-1 viral load assay in clinical specimens with reduced susceptibility to raltegravir [J] . Young Thomas P., Napolitano Laura A., Paquet Agnes C., Journal of Virological Methods . 2013,第2期

机译：雅培RealTime HIV-1病毒载量测定法靶向的临床样本中HIV-1整合酶区域的最小序列变异性，降低了对raltegravir的敏感性

3. Comparison of the Abbott Realtime™ HIV-1 and HCV viral load assays with commercial competitor assays [J] . Martin Schutten Expert Review of Molecular Diagnostics . 2008,第4期

机译：雅培Realtime™HIV-1和HCV病毒载量测定与商业竞争对手测定的比较

4. Using Realtime Rt-Pcr and Sequencing Assays to Define Viral Load, Types and Subtypes of Hepatitis C Virus at Cantho Center General Hospital [C] . CaoThi Tai Nguyen, Tran Ngoc Dung, Nguyen Thi Huynh Nga International Conference on Biomedical Engineering in Vietnam . 2015

机译：使用RealtimeTR-PCR和测序测定以在Cantho Center综合医院定义丙型肝炎病毒的病毒载荷，类型和亚型

5. Phylogenetic conservation of cis-regulatory regions using sequence alignability and cladistic motifs. [D] . King, David C. 2009

机译：使用序列比对和cladistic主题的顺式调节区域的系统发育养护。

6. Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay [O] . Gavin Cloherty, Neil Parkin, James Rhoads, 2014

机译：雅培实时HCV病毒载量测定法靶向的区域的序列保守性

7. Evaluation of the Aptima®HIV-1 Quant Dx assay for HIV-1 RNA viral load detection and quantitation in plasma of HIV-1-infected individuals: A comparison with Abbott RealTime HIV-1 assay [O] . Alessandra Amendola, Maria Pisciotta, Loredana Aleo, 2016

机译：评估HIV-1 RNA病毒载体检测和定量HIV-1感染个体血浆中APTIMA®Hiv-1Qual-DX测定：与Abbott Realtime HIV-1测定的比较

1. 雅培i2000化学发光分析仪检测HCV抗体的假阳性研究 [J] . 王镱达 . 中国医疗器械信息 . 2021,第018期

2. 应用ROC曲线评价强生VITROS3600和雅培i2000全自动免疫分析仪检测抗-HCV的性能 [J] . 刘瑶瑶 ,李锋 ,王菊英 . 宁夏医学杂志 . 2018,第002期

3. 雅培i2000化学发光分析仪检测HCV抗体的假阳性分析 [J] . 李峰 . 中国继续医学教育 . 2016,第026期

4. 雅培i2000化学发光分析仪检测HCV抗体的假阳性分析 [J] . 魏丽 ,孙翠平 . 医学信息 . 2015,第005期

5. 雅培i2000化学发光仪检测HCV抗体的性能评价 [J] . 陈蓓 ,孙翠平 . 医药前沿 . 2014,第023期

6. 中国流行HIV-1受体嗜性分析、HIV-1和HCV基因组序列ACA和UAH位点分析及HIV-1荧光实时定量RT-PCR的建立 [A] . 董万强 . 2011

1. 确定HCV核酸样本中预定区域核酸序列的方法和系统 [P] . 中国专利： CN104603285A . 2015-05-06

2. 基于线性区域生长的二维激光点云序列实时分割方法 [P] . 中国专利： CN107657621B . 2021.04.13

3. PROCESS AND REAGENT FOR THE DETECTION OF THE HCV SEQUENCE IN A SUSPECTED SEQUENCE THAT CONTAINS HCV POLYNUCLEOTIDE THAT INCLUDES A SELECTED TARGET REGION [P] . 外国专利： RO109952B1 . 1995-07-28

机译：检测包含选定目标区域的HCV多核苷酸的可疑序列中HCV序列的方法和试剂

4. New recombinant DNA encoding chimeric protein, useful for in vitro diagnosis of viral infections, comprises sequences encoding epitopic regions, a linker and a binding region [P] . 外国专利： FR2844519A1 . 2004-03-19

机译：可用于体外诊断病毒感染的编码嵌合蛋白的新型重组DNA，包含编码表位区域，接头和结合区域的序列

5. ASSAYABLE HEPATITIS C VIRAL REPLICON, ASSAYABLE REPLICON-CONTAINING CELL, AND SCREENING METHOD OF HCV INHIBITOR USING THE SAME [P] . 外国专利： KR100502864B1 . 2005-07-22

机译：可检测的丙型肝炎病毒复制子，可检测的含复制子的细胞，以及使用该病毒筛查HCV抑制剂的方法

相关主题

Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅