Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm

Alexander Mellmann; Thomas Weniger; Christoph Berssenbrügge; Ursula Keckevoet; Alexander W. Friedrich; Dag Harmsen; Hajo Grundmann

首页> 外文期刊>Journal of Clinical Microbiology >Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm

【24h】

Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm

机译：使用spa序列分型和BURP（基于重复模式）算法表征金黄色葡萄球菌自然种群之间的克隆相关性

获取原文

掌桥外文数据库（机构版） >>

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

We evaluated the BURP (based upon repeat patterns) algorithm, which relies on sequencing of the Staphylococcus aureus protein A gene (spa), for its ability to infer clonal relatedness within a population of 110 wild-type strains. BURP clustering of the resulting 66 spa types was highly concordant with multilocus sequence typing (96.5% concordance) and pulsed-field gel electrophoresis (94.9%).

机译：我们评估了BURP（基于重复模式）算法，该算法依赖于对金黄色葡萄球菌蛋白A基因（ spa ）的测序，从而能够推断出一个克隆中的克隆相关性。种群的110株野生型。产生的66个 spa 类型的BURP聚类与多位点序列分型（96.5％一致性）和脉冲场凝胶电泳（94.9％）高度一致。 展开▼

著录项

来源
《Journal of Clinical Microbiology》 |2008年第8期|共4页

作者
Alexander Mellmann; Thomas Weniger; Christoph Berssenbrügge; Ursula Keckevoet; Alexander W. Friedrich; Dag Harmsen; Hajo Grundmann;
展开▼

作者单位

展开▼

收录信息

原文格式 PDF

正文语种

中图分类医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）;

关键词

相似文献

外文文献

中文文献

专利

1. Based Upon Repeat Pattern (BURP): an algorithm to characterize the long-term evolution of Staphylococcus aureus populations based on spa polymorphisms [J] . Alexander Mellmann, Thomas Weniger, Christoph Berssenbr#252, BMC Microbiology . 2007,第1期

机译：基于重复模式（BURP）：一种基于spa多态性表征金黄色葡萄球菌种群长期进化的算法

2. Comparison of Multiple-Locus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis with Pulsed-Field Gel Electrophoresis, spa Typing, and Multilocus Sequence Typing for Clonal Characterization of Staphylococcus aureus Isolates [J] . Natalia Malachowa, Artur Sabat, Marek Gniadkowski, Journal of Clinical Microbiology . 2005,第7期

机译：脉冲场凝胶电泳，spa分型和多基因座序列分型用于金黄色葡萄球菌分离株克隆鉴定的多位点可变数目串联重复分析的比较

3. Typing of Staphylococcus aureus strains by PCR-amplification of variable-length 16S-23S rDNA spacer regions: characterization of spacer sequences [J] . Volker Gürtler, Helen D. Barrie Microbiology . 1995,第5期

机译：通过PCR扩增的可变长度16s-23s rdna间隔区的扩增键入金黄色葡萄球菌株：间隔序列的表征

4. Detection, Molecular Characterization, and Clonal Diversity of Methicillin- susceptible Staphylococcus aureus m Milk of Cows with Mastitis in Brazil [C] . Nathalia Silva, Felipe Guimaraes, Elena Gomez-Sanz, Annual Meeting of the National^Mastitis^Council . 2013

机译：巴西乳腺炎奶牛易感葡萄球菌的检测，分子表征和克隆多样性

5. Characterization of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus by pulsed-field gel electrophoresis, multilocus sequence typing, and Staphylococcal protein A sequencing: Establishing a strain typing database. [D] . Roberts, Jill Carolyne. 2006

机译：通过脉冲场凝胶电泳，多基因座序列分型和葡萄球菌蛋白A测序表征社区获得的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌：建立菌株分型数据库。

6. Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm [O] . Alexander Mellmann, Thomas Weniger, Christoph Berssenbrügge, 2008

机译：使用spa序列分型和BURP（基于重复模式）算法表征金黄色葡萄球菌自然种群之间的克隆相关性

7. Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm▿ [O] . Mellmann, Alexander, Weniger, Thomas, Berssenbrügge, Christoph, 2008

机译：利用spa序列分型和BURP（基于重复模式）算法表征金黄色葡萄球菌自然种群之间的克隆相关性▿

8. Phage Typing of 'Staphylococcus Aureus' Strains Using Experimental 'Staphylococcus Aureus' Phage 292. [R] . Blouse, L. E., Brockett, R. M., Burdick, K. N., 1978

机译：使用实验'金黄色葡萄球菌'噬菌体292对'金黄色葡萄球菌'菌株进行噬菌体分型。

1. 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌DNA重复序列PCR的分型研究 [J] . 曾海涛 ,李洁 . 医学临床研究 . 2000,第002期

2. 新生儿耐甲氧西林金黄色葡萄球菌多位点序列分型与耐药相关性分析 [J] . 杨帆 ,李淑梅 ,杨晓 . 中国实用儿科杂志 . 2011,第009期

3. 关于重复词句提取的两种算法分析——基于Suffix Tree和重复序列两种算法的实验结果比较 [J] . 殷波 ,蒋华 ,刘新平 . 内蒙古科技与经济 . 2009,第001期

4. 基于PrefixSpan序列模式挖掘的改进算法 [J] . 王斌 ,黄晓芳 ,袁平 . 西南科技大学学报 . 2016,第004期

5. 基于改进PrefixSpan的序列模式挖掘算法 [J] . 公伟 ,刘培玉 ,贾娴 . 计算机应用 . 2011,第009期

6. 基于序列模式挖掘和贝叶斯算法的代码克隆检测 [C] . Xu Bo-Wen ,徐博文 ,Xia Xin . 第十四届全国软件与应用学术会议 . 2015

7. 基于下一代测序技术构建42个常染色体短串联重复序列分型体系 [A] . 刘青霞 . 2019

1. 一种基于改进PrefixSpan算法的交易数据频繁序列模式挖掘方法 [P] . 中国专利： CN113505156A . 2021-10-15

2. 基于改进PrefixSpan算法的报警泛滥序列数据模式提取方法 [P] . 中国专利： CN112346421A . 2021-02-09

3. Immunogenic composition, useful for immunizing against Staphylococcus aureus infection, comprises capsular polysaccharide of type 8 and 5 of Staphylococcus aureus strain overproducing type 8 and/or type 5, respectively [P] . 外国专利： FR2899110A1 . 2007-10-05

机译：用于针对金黄色葡萄球菌感染进行免疫的免疫原性组合物包含分别过量生产8型和/或5型的金黄色葡萄球菌菌株的8和5型荚膜多糖。

4. SEQUENCES FOR THE DETECTION AND IDENTIFICATION OF METHICILLIN-RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS MREJ TYPE V STRAINS [P] . 外国专利： CA2899816C . 2018-05-01

机译：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MREJ V型菌株的检测和鉴定序列

5. Methods and sequences for the detection and identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus MREJ type v strains [P] . 外国专利： EP2322663B1 . 2015-03-18

机译：检测和鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MREJ v型菌株的方法和序列

相关主题

Characterization of Clonal Relatedness among the Natural Population of Staphylococcus aureus Strains by Using spa Sequence Typing and the BURP (Based upon Repeat Patterns) Algorithm

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅