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SNaPBceBcon: a Practical Tool for Identification and Genotyping of Burkholderia cepacia and Burkholderia contaminans

机译:SNaPBceBcon:洋葱伯克霍尔德氏菌和污染伯克霍尔德氏菌的鉴定和基因分型的实用工具

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摘要

We propose an optimized protocol for an extensive population analysis of Burkholderia cepacia and Burkholderia contaminans. Seven new polymorphisms were added to the recently proposed SNaPBcen assay, and a total of 18 markers ensured the clear identification and distinction of B. cepacia and B. contaminans isolates and high genotypic discrimination (Simpson index of 0.94) compared to those for multilocus sequence typing.
机译:我们提出了一种优化的方案,用于对洋葱伯克霍尔德菌和污染伯克霍尔德菌的大量人群进行分析。在最近提出的 SNaPBcen 分析中增加了七个新的多态性,共有18个标记确保了对洋葱伯克霍尔德菌和B. contaminans分离株的清晰鉴定和区分以及高基因型歧视(辛普森指数为0.94)相比于多基因座序列分型。

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