• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>Microorganisms >Genomic Insight of VIM-harboring IncA Plasmid from a Clinical ST69 Escherichia coli Strain in Italy
【24h】

Genomic Insight of VIM-harboring IncA Plasmid from a Clinical ST69 Escherichia coli Strain in Italy

机译：来自意大利临床ST69大肠杆菌菌株的Vim-Houseting Inca质粒的基因组洞察力

获取原文
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Background : VIM (Verona Integron-encoded Metallo-beta-lactamase) is a member of the Metallo-Beta-Lactamases (MBLs), and is able to hydrolyze all beta-lactams antibiotics, except for monobactams, and including carbapenems. Here we characterize a VIM-producing IncA plasmid isolated from a clinical ST69 Escherichia coli strain from an Italian Long-Term Care Facility (LTCF) inpatient. Methods : An antimicrobial susceptibility test and conjugation assay were carried out, and the transferability of the bla VIM-type gene was confirmed in the transconjugant. Whole-genome sequencing (WGS) of the strain 550 was performed using the Sequel I platform. Genome assembly was performed using “Microbial Assembly”. Genomic analysis was conducted by uploading the contigs to ResFinder and PlasmidFinder databases. Results: Assembly resulted in three complete circular contigs: the chromosome (4,962,700 bp), an IncA plasmid (p550_IncA_VIM_1; 162,608 bp), harboring genes coding for aminoglycoside resistance ( aac(6′)-Ib4 , ant(3″)-Ia , aph(3″)-Ib , aph(3′)-XV , aph(6)-Id ), beta-lactam resistance ( bla SHV-12 , bla VIM-1 ), macrolides resistance ( mph(A) ), phenicol resistance ( catB2 ), quinolones resistance ( qnrS1 ), sulphonamide resistance ( sul1 , sul2 ), and trimethoprim resistance ( dfrA14 ), and an IncK/Z plasmid (p550_IncB_O_K_Z; 100,306 bp), free of antibiotic resistance genes. Conclusions: The increase in reports of IncA plasmids bearing different antimicrobial resistance genes highlights the overall important role of IncA plasmids in disseminating carbapenemase genes, with a preference for the bla VIM-1 gene in Italy.
机译：背景：Vim（维罗纳积分编码的金属β-内酰胺酶）是金属β-内酰胺酶（MBL）的成员，并且能够水解所有β-内酰胺抗生素，除了单酰胺，包括肉豆蔻。在这里，我们表征了一种从意大利长期护理设施（LTCF）住院的临床ST69大肠杆菌菌株中分离的Vim产生的印加药质粒。方法：进行抗微生物易感性试验和缀合测定，并在经谐波中证实了BLA Vim型基因的可转移性。使用续集I平台进行菌株550的全基因组测序（WGS）。使用“微生物组件”进行基因组组件。通过将CONTIG上传到Resfinder和质粒料数据库来进行基因组分析。结果：组装导致三种完整的圆形葡萄片：染色体（4,962,700 bp），印加质粒（p550_inca_vim_1; 162,608 bp），含有氨基糖苷类抗性的基因（AAC（6'） - IB4，Ant（3“） - Ia， APH（3“） - IB，APH（3'） - XV，APH（6）-ID），β-内酰胺抗性（BLA SHV-12，BLA VIM-1），大胶质剂抗性（MPH（A）），苯上酚抗性（CATB2），喹诺酮抗性（QNRS1），磺酰胺抗性（SUL1，SUL2）和三甲双胍（DFRA14），以及INCK / Z质粒（P550_INCB_O_K_Z; 100,306bp），不含抗生素抗性基因。结论：轴承不同抗菌性基因的印加质粒报告的增加凸显了印加质粒在筛选碳结构酶基因方面的总体重要作用，偏好于意大利的BLA Vim-1基因。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号